Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR05

4931417E11Rik, RIKEN cDNA 4931417E11, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4931417E11RikQ9CR05 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
4931417E11RikQ9CR05 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
4931417E11RikQ9CR05 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
4931417E11RikQ9CR05 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4931417E11RikQ9CR05 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4931417E11RikQ9CR05 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
4931417E11RikQ9CR05 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4931417E11RikQ9CR05 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4931417E11RikQ9CR05 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4931417E11RikQ9CR05 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4931417E11RikQ9CR05 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4931417E11RikQ9CR05 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4931417E11RikQ9CR05 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4931417E11RikQ9CR05 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4931417E11RikQ9CR05 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4931417E11RikQ9CR05 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4931417E11RikQ9CR05 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4931417E11RikQ9CR05 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4931417E11RikQ9CR05 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4931417E11RikQ9CR05 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4931417E11RikQ9CR05 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
4931417E11RikQ9CR05 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4931417E11RikQ9CR05 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
4931417E11RikQ9CR05 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4931417E11RikQ9CR05 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4931417E11RikQ9CR05 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
4931417E11RikQ9CR05 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4931417E11RikQ9CR05 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
4931417E11RikQ9CR05 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4931417E11RikQ9CR05 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
4931417E11RikQ9CR05 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
4931417E11RikQ9CR05 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
4931417E11RikQ9CR05 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
4931417E11RikQ9CR05 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
4931417E11RikQ9CR05 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
4931417E11RikQ9CR05 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
4931417E11RikQ9CR05 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
4931417E11RikQ9CR05 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
4931417E11RikQ9CR05 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
4931417E11RikQ9CR05 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
4931417E11RikQ9CR05 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
4931417E11RikQ9CR05 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
4931417E11RikQ9CR05 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
4931417E11RikQ9CR05 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
4931417E11RikQ9CR05 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
4931417E11RikQ9CR05 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
4931417E11RikQ9CR05 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
4931417E11RikQ9CR05 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
4931417E11RikQ9CR05 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
4931417E11RikQ9CR05 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
4931417E11RikQ9CR05 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4931417E11RikQ9CR05 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
4931417E11RikQ9CR05 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4931417E11RikQ9CR05 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4931417E11RikQ9CR05 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
4931417E11RikQ9CR05 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4931417E11RikQ9CR05 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
4931417E11RikQ9CR05 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4931417E11RikQ9CR05 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
4931417E11RikQ9CR05 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4931417E11RikQ9CR05 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4931417E11RikQ9CR05 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
4931417E11RikQ9CR05 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
4931417E11RikQ9CR05 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
4931417E11RikQ9CR05 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
4931417E11RikQ9CR05 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4931417E11RikQ9CR05 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4931417E11RikQ9CR05 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4931417E11RikQ9CR05 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
4931417E11RikQ9CR05 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
4931417E11RikQ9CR05 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4931417E11RikQ9CR05 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4931417E11RikQ9CR05 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
4931417E11RikQ9CR05 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4931417E11RikQ9CR05 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4931417E11RikQ9CR05 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
4931417E11RikQ9CR05 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4931417E11RikQ9CR05 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4931417E11RikQ9CR05 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4931417E11RikQ9CR05 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4931417E11RikQ9CR05 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4931417E11RikQ9CR05 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4931417E11RikQ9CR05 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
4931417E11RikQ9CR05 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
4931417E11RikQ9CR05 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
4931417E11RikQ9CR05 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
4931417E11RikQ9CR05 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
4931417E11RikQ9CR05 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
4931417E11RikQ9CR05 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
4931417E11RikQ9CR05 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
4931417E11RikQ9CR05 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
4931417E11RikQ9CR05 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
4931417E11RikQ9CR05 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
4931417E11RikQ9CR05 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
4931417E11RikQ9CR05 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
4931417E11RikQ9CR05 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
4931417E11RikQ9CR05 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
4931417E11RikQ9CR05 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
4931417E11RikQ9CR05 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
4931417E11RikQ9CR05 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms