Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQY1

Atg12, Ubiquitin-like protein ATG12, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg12Q9CQY1 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Atg12Q9CQY1 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Atg12Q9CQY1 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Atg12Q9CQY1 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Atg12Q9CQY1 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Atg12Q9CQY1 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Atg12Q9CQY1 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Atg12Q9CQY1 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Atg12Q9CQY1 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Atg12Q9CQY1 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Atg12Q9CQY1 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Atg12Q9CQY1 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Atg12Q9CQY1 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Atg12Q9CQY1 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Atg12Q9CQY1 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Atg12Q9CQY1 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Atg12Q9CQY1 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Atg12Q9CQY1 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Atg12Q9CQY1 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Atg12Q9CQY1 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Atg12Q9CQY1 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Atg12Q9CQY1 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Atg12Q9CQY1 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Atg12Q9CQY1 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Atg12Q9CQY1 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Atg12Q9CQY1 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Atg12Q9CQY1 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Atg12Q9CQY1 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Atg12Q9CQY1 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Atg12Q9CQY1 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Atg12Q9CQY1 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Atg12Q9CQY1 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Atg12Q9CQY1 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Atg12Q9CQY1 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Atg12Q9CQY1 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Atg12Q9CQY1 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Atg12Q9CQY1 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Atg12Q9CQY1 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Atg12Q9CQY1 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Atg12Q9CQY1 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Atg12Q9CQY1 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Atg12Q9CQY1 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Atg12Q9CQY1 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Atg12Q9CQY1 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Atg12Q9CQY1 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Atg12Q9CQY1 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Atg12Q9CQY1 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Atg12Q9CQY1 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Atg12Q9CQY1 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Atg12Q9CQY1 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Atg12Q9CQY1 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Atg12Q9CQY1 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Atg12Q9CQY1 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Atg12Q9CQY1 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Atg12Q9CQY1 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Atg12Q9CQY1 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Atg12Q9CQY1 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Atg12Q9CQY1 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Atg12Q9CQY1 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Atg12Q9CQY1 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Atg12Q9CQY1 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Atg12Q9CQY1 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Atg12Q9CQY1 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Atg12Q9CQY1 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Atg12Q9CQY1 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Atg12Q9CQY1 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Atg12Q9CQY1 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Atg12Q9CQY1 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Atg12Q9CQY1 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Atg12Q9CQY1 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Atg12Q9CQY1 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Atg12Q9CQY1 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Atg12Q9CQY1 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Atg12Q9CQY1 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Atg12Q9CQY1 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Atg12Q9CQY1 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Atg12Q9CQY1 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Atg12Q9CQY1 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Atg12Q9CQY1 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Atg12Q9CQY1 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Atg12Q9CQY1 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Atg12Q9CQY1 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Atg12Q9CQY1 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Atg12Q9CQY1 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Atg12Q9CQY1 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Atg12Q9CQY1 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Atg12Q9CQY1 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Atg12Q9CQY1 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Atg12Q9CQY1 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Atg12Q9CQY1 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Atg12Q9CQY1 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Atg12Q9CQY1 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Atg12Q9CQY1 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Atg12Q9CQY1 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Atg12Q9CQY1 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Atg12Q9CQY1 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Atg12Q9CQY1 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Atg12Q9CQY1 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Atg12Q9CQY1 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Atg12Q9CQY1 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms