Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQT5

Pomp, Proteasome maturation protein, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PompQ9CQT5 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PompQ9CQT5 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PompQ9CQT5 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PompQ9CQT5 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PompQ9CQT5 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PompQ9CQT5 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PompQ9CQT5 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PompQ9CQT5 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PompQ9CQT5 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PompQ9CQT5 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PompQ9CQT5 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PompQ9CQT5 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PompQ9CQT5 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PompQ9CQT5 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PompQ9CQT5 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PompQ9CQT5 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PompQ9CQT5 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PompQ9CQT5 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PompQ9CQT5 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PompQ9CQT5 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PompQ9CQT5 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PompQ9CQT5 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PompQ9CQT5 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PompQ9CQT5 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PompQ9CQT5 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PompQ9CQT5 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PompQ9CQT5 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PompQ9CQT5 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PompQ9CQT5 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PompQ9CQT5 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PompQ9CQT5 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PompQ9CQT5 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PompQ9CQT5 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PompQ9CQT5 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PompQ9CQT5 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PompQ9CQT5 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PompQ9CQT5 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PompQ9CQT5 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PompQ9CQT5 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PompQ9CQT5 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PompQ9CQT5 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PompQ9CQT5 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PompQ9CQT5 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PompQ9CQT5 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PompQ9CQT5 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PompQ9CQT5 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PompQ9CQT5 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PompQ9CQT5 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PompQ9CQT5 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PompQ9CQT5 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PompQ9CQT5 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PompQ9CQT5 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PompQ9CQT5 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PompQ9CQT5 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PompQ9CQT5 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PompQ9CQT5 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PompQ9CQT5 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PompQ9CQT5 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PompQ9CQT5 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PompQ9CQT5 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PompQ9CQT5 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PompQ9CQT5 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PompQ9CQT5 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PompQ9CQT5 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PompQ9CQT5 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PompQ9CQT5 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PompQ9CQT5 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PompQ9CQT5 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PompQ9CQT5 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PompQ9CQT5 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PompQ9CQT5 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PompQ9CQT5 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PompQ9CQT5 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PompQ9CQT5 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PompQ9CQT5 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PompQ9CQT5 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PompQ9CQT5 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PompQ9CQT5 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PompQ9CQT5 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PompQ9CQT5 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PompQ9CQT5 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PompQ9CQT5 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PompQ9CQT5 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PompQ9CQT5 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PompQ9CQT5 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PompQ9CQT5 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PompQ9CQT5 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PompQ9CQT5 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PompQ9CQT5 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PompQ9CQT5 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PompQ9CQT5 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PompQ9CQT5 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PompQ9CQT5 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PompQ9CQT5 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PompQ9CQT5 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PompQ9CQT5 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PompQ9CQT5 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PompQ9CQT5 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PompQ9CQT5 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PompQ9CQT5 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms