Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQQ7

Atp5f1, ATP synthase F(0) complex subunit B1, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5f1Q9CQQ7 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp5f1Q9CQQ7 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp5f1Q9CQQ7 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp5f1Q9CQQ7 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp5f1Q9CQQ7 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp5f1Q9CQQ7 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp5f1Q9CQQ7 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp5f1Q9CQQ7 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp5f1Q9CQQ7 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp5f1Q9CQQ7 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp5f1Q9CQQ7 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp5f1Q9CQQ7 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp5f1Q9CQQ7 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp5f1Q9CQQ7 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp5f1Q9CQQ7 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp5f1Q9CQQ7 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp5f1Q9CQQ7 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp5f1Q9CQQ7 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp5f1Q9CQQ7 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp5f1Q9CQQ7 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp5f1Q9CQQ7 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp5f1Q9CQQ7 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp5f1Q9CQQ7 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp5f1Q9CQQ7 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp5f1Q9CQQ7 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp5f1Q9CQQ7 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp5f1Q9CQQ7 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp5f1Q9CQQ7 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp5f1Q9CQQ7 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp5f1Q9CQQ7 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp5f1Q9CQQ7 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp5f1Q9CQQ7 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp5f1Q9CQQ7 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp5f1Q9CQQ7 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp5f1Q9CQQ7 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp5f1Q9CQQ7 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp5f1Q9CQQ7 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp5f1Q9CQQ7 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp5f1Q9CQQ7 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp5f1Q9CQQ7 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp5f1Q9CQQ7 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp5f1Q9CQQ7 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp5f1Q9CQQ7 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp5f1Q9CQQ7 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp5f1Q9CQQ7 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp5f1Q9CQQ7 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp5f1Q9CQQ7 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp5f1Q9CQQ7 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp5f1Q9CQQ7 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp5f1Q9CQQ7 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp5f1Q9CQQ7 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp5f1Q9CQQ7 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp5f1Q9CQQ7 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp5f1Q9CQQ7 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp5f1Q9CQQ7 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp5f1Q9CQQ7 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp5f1Q9CQQ7 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp5f1Q9CQQ7 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp5f1Q9CQQ7 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp5f1Q9CQQ7 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp5f1Q9CQQ7 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp5f1Q9CQQ7 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp5f1Q9CQQ7 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp5f1Q9CQQ7 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp5f1Q9CQQ7 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp5f1Q9CQQ7 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp5f1Q9CQQ7 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp5f1Q9CQQ7 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp5f1Q9CQQ7 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atp5f1Q9CQQ7 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atp5f1Q9CQQ7 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atp5f1Q9CQQ7 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atp5f1Q9CQQ7 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atp5f1Q9CQQ7 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atp5f1Q9CQQ7 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atp5f1Q9CQQ7 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Atp5f1Q9CQQ7 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atp5f1Q9CQQ7 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atp5f1Q9CQQ7 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Atp5f1Q9CQQ7 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atp5f1Q9CQQ7 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atp5f1Q9CQQ7 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atp5f1Q9CQQ7 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atp5f1Q9CQQ7 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atp5f1Q9CQQ7 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atp5f1Q9CQQ7 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atp5f1Q9CQQ7 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atp5f1Q9CQQ7 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atp5f1Q9CQQ7 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atp5f1Q9CQQ7 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atp5f1Q9CQQ7 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atp5f1Q9CQQ7 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atp5f1Q9CQQ7 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atp5f1Q9CQQ7 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atp5f1Q9CQQ7 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atp5f1Q9CQQ7 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atp5f1Q9CQQ7 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atp5f1Q9CQQ7 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atp5f1Q9CQQ7 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atp5f1Q9CQQ7 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms