Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQQ0

Smim8, Small integral membrane protein 8, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim8Q9CQQ0 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Smim8Q9CQQ0 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Smim8Q9CQQ0 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Smim8Q9CQQ0 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Smim8Q9CQQ0 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Smim8Q9CQQ0 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Smim8Q9CQQ0 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Smim8Q9CQQ0 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Smim8Q9CQQ0 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Smim8Q9CQQ0 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Smim8Q9CQQ0 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Smim8Q9CQQ0 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Smim8Q9CQQ0 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Smim8Q9CQQ0 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Smim8Q9CQQ0 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Smim8Q9CQQ0 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Smim8Q9CQQ0 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Smim8Q9CQQ0 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Smim8Q9CQQ0 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Smim8Q9CQQ0 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Smim8Q9CQQ0 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Smim8Q9CQQ0 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Smim8Q9CQQ0 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Smim8Q9CQQ0 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Smim8Q9CQQ0 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Smim8Q9CQQ0 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Smim8Q9CQQ0 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Smim8Q9CQQ0 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Smim8Q9CQQ0 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Smim8Q9CQQ0 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Smim8Q9CQQ0 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Smim8Q9CQQ0 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Smim8Q9CQQ0 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Smim8Q9CQQ0 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Smim8Q9CQQ0 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Smim8Q9CQQ0 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Smim8Q9CQQ0 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Smim8Q9CQQ0 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Smim8Q9CQQ0 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Smim8Q9CQQ0 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Smim8Q9CQQ0 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Smim8Q9CQQ0 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Smim8Q9CQQ0 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Smim8Q9CQQ0 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Smim8Q9CQQ0 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Smim8Q9CQQ0 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Smim8Q9CQQ0 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Smim8Q9CQQ0 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Smim8Q9CQQ0 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Smim8Q9CQQ0 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Smim8Q9CQQ0 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Smim8Q9CQQ0 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Smim8Q9CQQ0 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Smim8Q9CQQ0 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Smim8Q9CQQ0 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Smim8Q9CQQ0 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Smim8Q9CQQ0 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Smim8Q9CQQ0 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Smim8Q9CQQ0 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Smim8Q9CQQ0 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Smim8Q9CQQ0 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Smim8Q9CQQ0 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
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Smim8Q9CQQ0 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Smim8Q9CQQ0 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Smim8Q9CQQ0 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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Smim8Q9CQQ0 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Smim8Q9CQQ0 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Smim8Q9CQQ0 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Smim8Q9CQQ0 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Smim8Q9CQQ0 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Smim8Q9CQQ0 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Smim8Q9CQQ0 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Smim8Q9CQQ0 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Smim8Q9CQQ0 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Smim8Q9CQQ0 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Smim8Q9CQQ0 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Smim8Q9CQQ0 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Smim8Q9CQQ0 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Smim8Q9CQQ0 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Smim8Q9CQQ0 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Smim8Q9CQQ0 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Smim8Q9CQQ0 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Smim8Q9CQQ0 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Smim8Q9CQQ0 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Smim8Q9CQQ0 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Smim8Q9CQQ0 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Smim8Q9CQQ0 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Smim8Q9CQQ0 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Smim8Q9CQQ0 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Smim8Q9CQQ0 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Smim8Q9CQQ0 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Smim8Q9CQQ0 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Smim8Q9CQQ0 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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