Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQM1

Type III endosome membrane protein TEMP, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CQM1 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9CQM1 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9CQM1 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9CQM1 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9CQM1 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9CQM1 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9CQM1 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9CQM1 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9CQM1 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9CQM1 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9CQM1 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9CQM1 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9CQM1 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9CQM1 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9CQM1 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9CQM1 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9CQM1 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9CQM1 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9CQM1 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9CQM1 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9CQM1 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9CQM1 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9CQM1 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9CQM1 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9CQM1 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9CQM1 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9CQM1 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9CQM1 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9CQM1 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9CQM1 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9CQM1 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9CQM1 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9CQM1 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9CQM1 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9CQM1 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9CQM1 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9CQM1 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9CQM1 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9CQM1 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9CQM1 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9CQM1 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9CQM1 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9CQM1 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9CQM1 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9CQM1 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9CQM1 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9CQM1 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9CQM1 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9CQM1 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9CQM1 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9CQM1 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9CQM1 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9CQM1 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9CQM1 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9CQM1 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9CQM1 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9CQM1 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9CQM1 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9CQM1 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9CQM1 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9CQM1 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9CQM1 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9CQM1 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9CQM1 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9CQM1 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9CQM1 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9CQM1 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9CQM1 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9CQM1 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9CQM1 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9CQM1 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9CQM1 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9CQM1 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9CQM1 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9CQM1 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9CQM1 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9CQM1 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9CQM1 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9CQM1 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9CQM1 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9CQM1 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9CQM1 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9CQM1 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9CQM1 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9CQM1 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9CQM1 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9CQM1 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9CQM1 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9CQM1 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9CQM1 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9CQM1 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9CQM1 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9CQM1 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9CQM1 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9CQM1 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9CQM1 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9CQM1 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9CQM1 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9CQM1 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9CQM1 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms