Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQJ1

Higd2a, HIG1 domain family member 2A, mousemouse

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd2aQ9CQJ1 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Higd2aQ9CQJ1 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Higd2aQ9CQJ1 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Higd2aQ9CQJ1 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Higd2aQ9CQJ1 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Higd2aQ9CQJ1 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Higd2aQ9CQJ1 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Higd2aQ9CQJ1 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Higd2aQ9CQJ1 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Higd2aQ9CQJ1 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Higd2aQ9CQJ1 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Higd2aQ9CQJ1 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Higd2aQ9CQJ1 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Higd2aQ9CQJ1 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Higd2aQ9CQJ1 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Higd2aQ9CQJ1 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Higd2aQ9CQJ1 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Higd2aQ9CQJ1 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Higd2aQ9CQJ1 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Higd2aQ9CQJ1 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Higd2aQ9CQJ1 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Higd2aQ9CQJ1 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Higd2aQ9CQJ1 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Higd2aQ9CQJ1 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Higd2aQ9CQJ1 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Higd2aQ9CQJ1 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Higd2aQ9CQJ1 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Higd2aQ9CQJ1 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Higd2aQ9CQJ1 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Higd2aQ9CQJ1 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Higd2aQ9CQJ1 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Higd2aQ9CQJ1 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Higd2aQ9CQJ1 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Higd2aQ9CQJ1 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Higd2aQ9CQJ1 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Higd2aQ9CQJ1 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Higd2aQ9CQJ1 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Higd2aQ9CQJ1 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Higd2aQ9CQJ1 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Higd2aQ9CQJ1 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Higd2aQ9CQJ1 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Higd2aQ9CQJ1 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Higd2aQ9CQJ1 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Higd2aQ9CQJ1 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Higd2aQ9CQJ1 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Higd2aQ9CQJ1 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Higd2aQ9CQJ1 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Higd2aQ9CQJ1 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Higd2aQ9CQJ1 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Higd2aQ9CQJ1 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Higd2aQ9CQJ1 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Higd2aQ9CQJ1 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Higd2aQ9CQJ1 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Higd2aQ9CQJ1 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Higd2aQ9CQJ1 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Higd2aQ9CQJ1 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Higd2aQ9CQJ1 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Higd2aQ9CQJ1 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Higd2aQ9CQJ1 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Higd2aQ9CQJ1 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Higd2aQ9CQJ1 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Higd2aQ9CQJ1 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Higd2aQ9CQJ1 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Higd2aQ9CQJ1 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Higd2aQ9CQJ1 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Higd2aQ9CQJ1 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Higd2aQ9CQJ1 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Higd2aQ9CQJ1 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Higd2aQ9CQJ1 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Higd2aQ9CQJ1 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Higd2aQ9CQJ1 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Higd2aQ9CQJ1 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Higd2aQ9CQJ1 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Higd2aQ9CQJ1 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Higd2aQ9CQJ1 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Higd2aQ9CQJ1 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Higd2aQ9CQJ1 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Higd2aQ9CQJ1 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Higd2aQ9CQJ1 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Higd2aQ9CQJ1 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Higd2aQ9CQJ1 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Higd2aQ9CQJ1 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Higd2aQ9CQJ1 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Higd2aQ9CQJ1 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Higd2aQ9CQJ1 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Higd2aQ9CQJ1 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Higd2aQ9CQJ1 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Higd2aQ9CQJ1 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Higd2aQ9CQJ1 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Higd2aQ9CQJ1 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Higd2aQ9CQJ1 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Higd2aQ9CQJ1 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Higd2aQ9CQJ1 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Higd2aQ9CQJ1 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Higd2aQ9CQJ1 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Higd2aQ9CQJ1 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Higd2aQ9CQJ1 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Higd2aQ9CQJ1 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Higd2aQ9CQJ1 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Higd2aQ9CQJ1 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms