Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQF4

Uncharacterized protein C6orf203 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CQF4 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9CQF4 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9CQF4 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9CQF4 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9CQF4 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9CQF4 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9CQF4 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9CQF4 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9CQF4 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9CQF4 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9CQF4 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9CQF4 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9CQF4 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9CQF4 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9CQF4 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9CQF4 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9CQF4 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9CQF4 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9CQF4 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9CQF4 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9CQF4 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9CQF4 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9CQF4 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9CQF4 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9CQF4 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9CQF4 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9CQF4 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9CQF4 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9CQF4 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9CQF4 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9CQF4 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9CQF4 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9CQF4 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9CQF4 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9CQF4 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9CQF4 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9CQF4 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9CQF4 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9CQF4 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9CQF4 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9CQF4 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9CQF4 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9CQF4 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9CQF4 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9CQF4 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9CQF4 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9CQF4 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9CQF4 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9CQF4 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9CQF4 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9CQF4 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9CQF4 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9CQF4 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9CQF4 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9CQF4 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9CQF4 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9CQF4 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9CQF4 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9CQF4 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9CQF4 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9CQF4 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9CQF4 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9CQF4 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9CQF4 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9CQF4 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9CQF4 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9CQF4 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9CQF4 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9CQF4 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9CQF4 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9CQF4 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9CQF4 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9CQF4 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9CQF4 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9CQF4 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9CQF4 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9CQF4 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9CQF4 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Q9CQF4 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Q9CQF4 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Q9CQF4 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9CQF4 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9CQF4 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9CQF4 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9CQF4 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9CQF4 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9CQF4 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9CQF4 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9CQF4 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9CQF4 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9CQF4 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9CQF4 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9CQF4 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9CQF4 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9CQF4 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9CQF4 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9CQF4 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9CQF4 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9CQF4 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9CQF4 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms