Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQF0

Mrpl11, 39S ribosomal protein L11, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl11Q9CQF0 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mrpl11Q9CQF0 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mrpl11Q9CQF0 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mrpl11Q9CQF0 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mrpl11Q9CQF0 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mrpl11Q9CQF0 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mrpl11Q9CQF0 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mrpl11Q9CQF0 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mrpl11Q9CQF0 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mrpl11Q9CQF0 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mrpl11Q9CQF0 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Mrpl11Q9CQF0 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mrpl11Q9CQF0 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Mrpl11Q9CQF0 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mrpl11Q9CQF0 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mrpl11Q9CQF0 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mrpl11Q9CQF0 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mrpl11Q9CQF0 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mrpl11Q9CQF0 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mrpl11Q9CQF0 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mrpl11Q9CQF0 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mrpl11Q9CQF0 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mrpl11Q9CQF0 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mrpl11Q9CQF0 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mrpl11Q9CQF0 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mrpl11Q9CQF0 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mrpl11Q9CQF0 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mrpl11Q9CQF0 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mrpl11Q9CQF0 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mrpl11Q9CQF0 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mrpl11Q9CQF0 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mrpl11Q9CQF0 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mrpl11Q9CQF0 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Mrpl11Q9CQF0 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mrpl11Q9CQF0 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mrpl11Q9CQF0 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mrpl11Q9CQF0 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mrpl11Q9CQF0 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mrpl11Q9CQF0 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mrpl11Q9CQF0 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mrpl11Q9CQF0 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Mrpl11Q9CQF0 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mrpl11Q9CQF0 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mrpl11Q9CQF0 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mrpl11Q9CQF0 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mrpl11Q9CQF0 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mrpl11Q9CQF0 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mrpl11Q9CQF0 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mrpl11Q9CQF0 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mrpl11Q9CQF0 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mrpl11Q9CQF0 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Mrpl11Q9CQF0 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mrpl11Q9CQF0 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mrpl11Q9CQF0 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mrpl11Q9CQF0 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mrpl11Q9CQF0 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Mrpl11Q9CQF0 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Mrpl11Q9CQF0 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC18.46■□□□□ 0.54
Mrpl11Q9CQF0 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mrpl11Q9CQF0 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mrpl11Q9CQF0 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mrpl11Q9CQF0 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mrpl11Q9CQF0 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mrpl11Q9CQF0 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mrpl11Q9CQF0 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Mrpl11Q9CQF0 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mrpl11Q9CQF0 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mrpl11Q9CQF0 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mrpl11Q9CQF0 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Mrpl11Q9CQF0 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mrpl11Q9CQF0 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mrpl11Q9CQF0 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mrpl11Q9CQF0 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mrpl11Q9CQF0 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mrpl11Q9CQF0 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mrpl11Q9CQF0 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mrpl11Q9CQF0 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mrpl11Q9CQF0 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mrpl11Q9CQF0 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mrpl11Q9CQF0 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mrpl11Q9CQF0 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mrpl11Q9CQF0 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mrpl11Q9CQF0 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Mrpl11Q9CQF0 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Mrpl11Q9CQF0 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mrpl11Q9CQF0 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Mrpl11Q9CQF0 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mrpl11Q9CQF0 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mrpl11Q9CQF0 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mrpl11Q9CQF0 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mrpl11Q9CQF0 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mrpl11Q9CQF0 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mrpl11Q9CQF0 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mrpl11Q9CQF0 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mrpl11Q9CQF0 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mrpl11Q9CQF0 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mrpl11Q9CQF0 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mrpl11Q9CQF0 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mrpl11Q9CQF0 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mrpl11Q9CQF0 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.1 ms