Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD0

Rpl39l, RIKEN cDNA 4930517K11, mousemouse

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Length 51 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl39lQ9CQD0 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rpl39lQ9CQD0 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rpl39lQ9CQD0 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rpl39lQ9CQD0 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Rpl39lQ9CQD0 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rpl39lQ9CQD0 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rpl39lQ9CQD0 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rpl39lQ9CQD0 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
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Rpl39lQ9CQD0 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rpl39lQ9CQD0 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rpl39lQ9CQD0 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Rpl39lQ9CQD0 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rpl39lQ9CQD0 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rpl39lQ9CQD0 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rpl39lQ9CQD0 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
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Rpl39lQ9CQD0 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rpl39lQ9CQD0 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rpl39lQ9CQD0 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rpl39lQ9CQD0 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rpl39lQ9CQD0 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rpl39lQ9CQD0 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
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Rpl39lQ9CQD0 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
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Rpl39lQ9CQD0 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rpl39lQ9CQD0 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rpl39lQ9CQD0 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rpl39lQ9CQD0 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
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Rpl39lQ9CQD0 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rpl39lQ9CQD0 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
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Rpl39lQ9CQD0 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
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Rpl39lQ9CQD0 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
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Rpl39lQ9CQD0 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rpl39lQ9CQD0 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rpl39lQ9CQD0 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rpl39lQ9CQD0 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rpl39lQ9CQD0 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rpl39lQ9CQD0 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rpl39lQ9CQD0 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rpl39lQ9CQD0 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
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Rpl39lQ9CQD0 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
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Rpl39lQ9CQD0 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
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Rpl39lQ9CQD0 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rpl39lQ9CQD0 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
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Rpl39lQ9CQD0 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rpl39lQ9CQD0 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
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Rpl39lQ9CQD0 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rpl39lQ9CQD0 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rpl39lQ9CQD0 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Rpl39lQ9CQD0 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
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Rpl39lQ9CQD0 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rpl39lQ9CQD0 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rpl39lQ9CQD0 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rpl39lQ9CQD0 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rpl39lQ9CQD0 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rpl39lQ9CQD0 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rpl39lQ9CQD0 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rpl39lQ9CQD0 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rpl39lQ9CQD0 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rpl39lQ9CQD0 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rpl39lQ9CQD0 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rpl39lQ9CQD0 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rpl39lQ9CQD0 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rpl39lQ9CQD0 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rpl39lQ9CQD0 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
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