Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQA1

Trappc5, Trafficking protein particle complex subunit 5, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc5Q9CQA1 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Trappc5Q9CQA1 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trappc5Q9CQA1 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trappc5Q9CQA1 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trappc5Q9CQA1 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trappc5Q9CQA1 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trappc5Q9CQA1 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trappc5Q9CQA1 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc5Q9CQA1 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc5Q9CQA1 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc5Q9CQA1 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc5Q9CQA1 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc5Q9CQA1 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc5Q9CQA1 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc5Q9CQA1 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc5Q9CQA1 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc5Q9CQA1 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc5Q9CQA1 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc5Q9CQA1 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc5Q9CQA1 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc5Q9CQA1 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc5Q9CQA1 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc5Q9CQA1 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc5Q9CQA1 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc5Q9CQA1 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc5Q9CQA1 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc5Q9CQA1 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc5Q9CQA1 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc5Q9CQA1 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc5Q9CQA1 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trappc5Q9CQA1 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trappc5Q9CQA1 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trappc5Q9CQA1 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trappc5Q9CQA1 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trappc5Q9CQA1 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trappc5Q9CQA1 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trappc5Q9CQA1 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trappc5Q9CQA1 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trappc5Q9CQA1 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trappc5Q9CQA1 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trappc5Q9CQA1 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trappc5Q9CQA1 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trappc5Q9CQA1 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trappc5Q9CQA1 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Trappc5Q9CQA1 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trappc5Q9CQA1 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trappc5Q9CQA1 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trappc5Q9CQA1 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trappc5Q9CQA1 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trappc5Q9CQA1 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trappc5Q9CQA1 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc5Q9CQA1 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc5Q9CQA1 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc5Q9CQA1 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc5Q9CQA1 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc5Q9CQA1 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc5Q9CQA1 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc5Q9CQA1 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc5Q9CQA1 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc5Q9CQA1 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc5Q9CQA1 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc5Q9CQA1 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc5Q9CQA1 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc5Q9CQA1 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc5Q9CQA1 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc5Q9CQA1 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc5Q9CQA1 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trappc5Q9CQA1 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trappc5Q9CQA1 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trappc5Q9CQA1 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trappc5Q9CQA1 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trappc5Q9CQA1 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trappc5Q9CQA1 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trappc5Q9CQA1 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trappc5Q9CQA1 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trappc5Q9CQA1 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trappc5Q9CQA1 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trappc5Q9CQA1 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Trappc5Q9CQA1 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trappc5Q9CQA1 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trappc5Q9CQA1 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trappc5Q9CQA1 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trappc5Q9CQA1 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trappc5Q9CQA1 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trappc5Q9CQA1 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trappc5Q9CQA1 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trappc5Q9CQA1 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trappc5Q9CQA1 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trappc5Q9CQA1 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trappc5Q9CQA1 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trappc5Q9CQA1 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trappc5Q9CQA1 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trappc5Q9CQA1 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trappc5Q9CQA1 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trappc5Q9CQA1 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trappc5Q9CQA1 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trappc5Q9CQA1 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trappc5Q9CQA1 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trappc5Q9CQA1 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trappc5Q9CQA1 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms