Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ71

Rpa3, Replication protein A 14 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpa3Q9CQ71 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rpa3Q9CQ71 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rpa3Q9CQ71 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rpa3Q9CQ71 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rpa3Q9CQ71 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rpa3Q9CQ71 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rpa3Q9CQ71 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rpa3Q9CQ71 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rpa3Q9CQ71 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rpa3Q9CQ71 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rpa3Q9CQ71 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rpa3Q9CQ71 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rpa3Q9CQ71 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rpa3Q9CQ71 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rpa3Q9CQ71 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Rpa3Q9CQ71 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rpa3Q9CQ71 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rpa3Q9CQ71 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rpa3Q9CQ71 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rpa3Q9CQ71 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rpa3Q9CQ71 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rpa3Q9CQ71 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rpa3Q9CQ71 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rpa3Q9CQ71 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rpa3Q9CQ71 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rpa3Q9CQ71 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rpa3Q9CQ71 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rpa3Q9CQ71 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rpa3Q9CQ71 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rpa3Q9CQ71 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rpa3Q9CQ71 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rpa3Q9CQ71 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rpa3Q9CQ71 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rpa3Q9CQ71 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rpa3Q9CQ71 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rpa3Q9CQ71 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rpa3Q9CQ71 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rpa3Q9CQ71 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rpa3Q9CQ71 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rpa3Q9CQ71 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rpa3Q9CQ71 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rpa3Q9CQ71 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rpa3Q9CQ71 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rpa3Q9CQ71 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rpa3Q9CQ71 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rpa3Q9CQ71 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rpa3Q9CQ71 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rpa3Q9CQ71 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rpa3Q9CQ71 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rpa3Q9CQ71 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rpa3Q9CQ71 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rpa3Q9CQ71 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rpa3Q9CQ71 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rpa3Q9CQ71 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rpa3Q9CQ71 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rpa3Q9CQ71 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rpa3Q9CQ71 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rpa3Q9CQ71 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rpa3Q9CQ71 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rpa3Q9CQ71 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rpa3Q9CQ71 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rpa3Q9CQ71 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rpa3Q9CQ71 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rpa3Q9CQ71 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rpa3Q9CQ71 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rpa3Q9CQ71 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rpa3Q9CQ71 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rpa3Q9CQ71 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rpa3Q9CQ71 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rpa3Q9CQ71 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rpa3Q9CQ71 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rpa3Q9CQ71 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rpa3Q9CQ71 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rpa3Q9CQ71 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rpa3Q9CQ71 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rpa3Q9CQ71 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rpa3Q9CQ71 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rpa3Q9CQ71 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rpa3Q9CQ71 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rpa3Q9CQ71 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rpa3Q9CQ71 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rpa3Q9CQ71 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rpa3Q9CQ71 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rpa3Q9CQ71 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rpa3Q9CQ71 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Rpa3Q9CQ71 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Rpa3Q9CQ71 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rpa3Q9CQ71 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rpa3Q9CQ71 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rpa3Q9CQ71 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rpa3Q9CQ71 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Rpa3Q9CQ71 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rpa3Q9CQ71 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rpa3Q9CQ71 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rpa3Q9CQ71 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rpa3Q9CQ71 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rpa3Q9CQ71 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Rpa3Q9CQ71 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rpa3Q9CQ71 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rpa3Q9CQ71 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms