Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ56

Use1, Vesicle transport protein USE1, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Use1Q9CQ56 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Use1Q9CQ56 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Use1Q9CQ56 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Use1Q9CQ56 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Use1Q9CQ56 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Use1Q9CQ56 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Use1Q9CQ56 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Use1Q9CQ56 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Use1Q9CQ56 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Use1Q9CQ56 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Use1Q9CQ56 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Use1Q9CQ56 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Use1Q9CQ56 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Use1Q9CQ56 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Use1Q9CQ56 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Use1Q9CQ56 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Use1Q9CQ56 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Use1Q9CQ56 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Use1Q9CQ56 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Use1Q9CQ56 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Use1Q9CQ56 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Use1Q9CQ56 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Use1Q9CQ56 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Use1Q9CQ56 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Use1Q9CQ56 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Use1Q9CQ56 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Use1Q9CQ56 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Use1Q9CQ56 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Use1Q9CQ56 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
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Use1Q9CQ56 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
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Use1Q9CQ56 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Use1Q9CQ56 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Use1Q9CQ56 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Use1Q9CQ56 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Use1Q9CQ56 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Use1Q9CQ56 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Use1Q9CQ56 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Use1Q9CQ56 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Use1Q9CQ56 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Use1Q9CQ56 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
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Use1Q9CQ56 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Use1Q9CQ56 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Use1Q9CQ56 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Use1Q9CQ56 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Use1Q9CQ56 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Use1Q9CQ56 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Use1Q9CQ56 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Use1Q9CQ56 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
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Use1Q9CQ56 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Use1Q9CQ56 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Use1Q9CQ56 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Use1Q9CQ56 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Use1Q9CQ56 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Use1Q9CQ56 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Use1Q9CQ56 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Use1Q9CQ56 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Use1Q9CQ56 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Use1Q9CQ56 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Use1Q9CQ56 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Use1Q9CQ56 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Use1Q9CQ56 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Use1Q9CQ56 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Use1Q9CQ56 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Use1Q9CQ56 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Use1Q9CQ56 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Use1Q9CQ56 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Use1Q9CQ56 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Use1Q9CQ56 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Use1Q9CQ56 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Use1Q9CQ56 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Use1Q9CQ56 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Use1Q9CQ56 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Use1Q9CQ56 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Use1Q9CQ56 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Use1Q9CQ56 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Use1Q9CQ56 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Use1Q9CQ56 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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