Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ45

Nenf, Neudesin, mousemouse

Predictions only

Length 171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NenfQ9CQ45 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NenfQ9CQ45 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NenfQ9CQ45 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NenfQ9CQ45 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NenfQ9CQ45 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NenfQ9CQ45 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NenfQ9CQ45 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NenfQ9CQ45 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NenfQ9CQ45 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NenfQ9CQ45 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NenfQ9CQ45 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NenfQ9CQ45 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NenfQ9CQ45 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NenfQ9CQ45 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NenfQ9CQ45 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
NenfQ9CQ45 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NenfQ9CQ45 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NenfQ9CQ45 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NenfQ9CQ45 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NenfQ9CQ45 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NenfQ9CQ45 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NenfQ9CQ45 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NenfQ9CQ45 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NenfQ9CQ45 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NenfQ9CQ45 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NenfQ9CQ45 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NenfQ9CQ45 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NenfQ9CQ45 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NenfQ9CQ45 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NenfQ9CQ45 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NenfQ9CQ45 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NenfQ9CQ45 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NenfQ9CQ45 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NenfQ9CQ45 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NenfQ9CQ45 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NenfQ9CQ45 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NenfQ9CQ45 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NenfQ9CQ45 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NenfQ9CQ45 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NenfQ9CQ45 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NenfQ9CQ45 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NenfQ9CQ45 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NenfQ9CQ45 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NenfQ9CQ45 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NenfQ9CQ45 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
NenfQ9CQ45 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NenfQ9CQ45 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NenfQ9CQ45 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NenfQ9CQ45 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NenfQ9CQ45 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NenfQ9CQ45 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NenfQ9CQ45 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NenfQ9CQ45 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NenfQ9CQ45 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NenfQ9CQ45 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NenfQ9CQ45 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NenfQ9CQ45 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NenfQ9CQ45 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NenfQ9CQ45 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NenfQ9CQ45 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
NenfQ9CQ45 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NenfQ9CQ45 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NenfQ9CQ45 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NenfQ9CQ45 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NenfQ9CQ45 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NenfQ9CQ45 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NenfQ9CQ45 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NenfQ9CQ45 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NenfQ9CQ45 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
NenfQ9CQ45 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NenfQ9CQ45 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NenfQ9CQ45 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NenfQ9CQ45 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NenfQ9CQ45 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NenfQ9CQ45 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NenfQ9CQ45 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
NenfQ9CQ45 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NenfQ9CQ45 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NenfQ9CQ45 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NenfQ9CQ45 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NenfQ9CQ45 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NenfQ9CQ45 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NenfQ9CQ45 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NenfQ9CQ45 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NenfQ9CQ45 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NenfQ9CQ45 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NenfQ9CQ45 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NenfQ9CQ45 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NenfQ9CQ45 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NenfQ9CQ45 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NenfQ9CQ45 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NenfQ9CQ45 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NenfQ9CQ45 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
NenfQ9CQ45 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NenfQ9CQ45 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NenfQ9CQ45 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NenfQ9CQ45 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NenfQ9CQ45 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NenfQ9CQ45 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NenfQ9CQ45 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms