Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ26

Stambp, STAM-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
StambpQ9CQ26 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
StambpQ9CQ26 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
StambpQ9CQ26 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
StambpQ9CQ26 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
StambpQ9CQ26 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
StambpQ9CQ26 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
StambpQ9CQ26 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
StambpQ9CQ26 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
StambpQ9CQ26 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
StambpQ9CQ26 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
StambpQ9CQ26 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
StambpQ9CQ26 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
StambpQ9CQ26 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
StambpQ9CQ26 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
StambpQ9CQ26 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
StambpQ9CQ26 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
StambpQ9CQ26 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
StambpQ9CQ26 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
StambpQ9CQ26 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
StambpQ9CQ26 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
StambpQ9CQ26 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
StambpQ9CQ26 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
StambpQ9CQ26 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
StambpQ9CQ26 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
StambpQ9CQ26 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
StambpQ9CQ26 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
StambpQ9CQ26 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
StambpQ9CQ26 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
StambpQ9CQ26 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
StambpQ9CQ26 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
StambpQ9CQ26 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
StambpQ9CQ26 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
StambpQ9CQ26 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
StambpQ9CQ26 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
StambpQ9CQ26 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
StambpQ9CQ26 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
StambpQ9CQ26 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
StambpQ9CQ26 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
StambpQ9CQ26 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
StambpQ9CQ26 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
StambpQ9CQ26 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
StambpQ9CQ26 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
StambpQ9CQ26 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
StambpQ9CQ26 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
StambpQ9CQ26 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
StambpQ9CQ26 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
StambpQ9CQ26 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
StambpQ9CQ26 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
StambpQ9CQ26 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
StambpQ9CQ26 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
StambpQ9CQ26 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
StambpQ9CQ26 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
StambpQ9CQ26 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
StambpQ9CQ26 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
StambpQ9CQ26 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
StambpQ9CQ26 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
StambpQ9CQ26 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
StambpQ9CQ26 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
StambpQ9CQ26 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
StambpQ9CQ26 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
StambpQ9CQ26 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
StambpQ9CQ26 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
StambpQ9CQ26 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
StambpQ9CQ26 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
StambpQ9CQ26 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
StambpQ9CQ26 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
StambpQ9CQ26 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
StambpQ9CQ26 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
StambpQ9CQ26 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
StambpQ9CQ26 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
StambpQ9CQ26 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
StambpQ9CQ26 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
StambpQ9CQ26 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
StambpQ9CQ26 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
StambpQ9CQ26 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
StambpQ9CQ26 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
StambpQ9CQ26 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
StambpQ9CQ26 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
StambpQ9CQ26 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
StambpQ9CQ26 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
StambpQ9CQ26 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
StambpQ9CQ26 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
StambpQ9CQ26 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
StambpQ9CQ26 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
StambpQ9CQ26 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
StambpQ9CQ26 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
StambpQ9CQ26 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
StambpQ9CQ26 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
StambpQ9CQ26 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
StambpQ9CQ26 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
StambpQ9CQ26 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
StambpQ9CQ26 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
StambpQ9CQ26 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
StambpQ9CQ26 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
StambpQ9CQ26 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
StambpQ9CQ26 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
StambpQ9CQ26 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
StambpQ9CQ26 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
StambpQ9CQ26 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
StambpQ9CQ26 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms