Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ14

Trpd52l3, Tumor protein D52-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpd52l3Q9CQ14 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trpd52l3Q9CQ14 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trpd52l3Q9CQ14 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Trpd52l3Q9CQ14 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trpd52l3Q9CQ14 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trpd52l3Q9CQ14 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trpd52l3Q9CQ14 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trpd52l3Q9CQ14 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trpd52l3Q9CQ14 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trpd52l3Q9CQ14 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trpd52l3Q9CQ14 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trpd52l3Q9CQ14 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trpd52l3Q9CQ14 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Trpd52l3Q9CQ14 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trpd52l3Q9CQ14 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trpd52l3Q9CQ14 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trpd52l3Q9CQ14 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Trpd52l3Q9CQ14 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trpd52l3Q9CQ14 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trpd52l3Q9CQ14 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trpd52l3Q9CQ14 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trpd52l3Q9CQ14 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trpd52l3Q9CQ14 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trpd52l3Q9CQ14 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trpd52l3Q9CQ14 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trpd52l3Q9CQ14 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trpd52l3Q9CQ14 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trpd52l3Q9CQ14 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trpd52l3Q9CQ14 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trpd52l3Q9CQ14 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trpd52l3Q9CQ14 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trpd52l3Q9CQ14 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trpd52l3Q9CQ14 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trpd52l3Q9CQ14 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trpd52l3Q9CQ14 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trpd52l3Q9CQ14 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trpd52l3Q9CQ14 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trpd52l3Q9CQ14 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trpd52l3Q9CQ14 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trpd52l3Q9CQ14 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trpd52l3Q9CQ14 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trpd52l3Q9CQ14 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trpd52l3Q9CQ14 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trpd52l3Q9CQ14 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Trpd52l3Q9CQ14 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trpd52l3Q9CQ14 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Trpd52l3Q9CQ14 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trpd52l3Q9CQ14 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trpd52l3Q9CQ14 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trpd52l3Q9CQ14 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trpd52l3Q9CQ14 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trpd52l3Q9CQ14 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trpd52l3Q9CQ14 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trpd52l3Q9CQ14 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trpd52l3Q9CQ14 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trpd52l3Q9CQ14 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trpd52l3Q9CQ14 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Trpd52l3Q9CQ14 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trpd52l3Q9CQ14 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trpd52l3Q9CQ14 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trpd52l3Q9CQ14 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trpd52l3Q9CQ14 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trpd52l3Q9CQ14 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Trpd52l3Q9CQ14 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trpd52l3Q9CQ14 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trpd52l3Q9CQ14 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trpd52l3Q9CQ14 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trpd52l3Q9CQ14 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trpd52l3Q9CQ14 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Trpd52l3Q9CQ14 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Trpd52l3Q9CQ14 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trpd52l3Q9CQ14 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trpd52l3Q9CQ14 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trpd52l3Q9CQ14 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trpd52l3Q9CQ14 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trpd52l3Q9CQ14 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trpd52l3Q9CQ14 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trpd52l3Q9CQ14 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trpd52l3Q9CQ14 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trpd52l3Q9CQ14 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trpd52l3Q9CQ14 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trpd52l3Q9CQ14 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trpd52l3Q9CQ14 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trpd52l3Q9CQ14 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trpd52l3Q9CQ14 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trpd52l3Q9CQ14 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trpd52l3Q9CQ14 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trpd52l3Q9CQ14 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trpd52l3Q9CQ14 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trpd52l3Q9CQ14 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trpd52l3Q9CQ14 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trpd52l3Q9CQ14 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trpd52l3Q9CQ14 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trpd52l3Q9CQ14 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trpd52l3Q9CQ14 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trpd52l3Q9CQ14 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trpd52l3Q9CQ14 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trpd52l3Q9CQ14 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trpd52l3Q9CQ14 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trpd52l3Q9CQ14 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms