Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ10

Chmp3, Charged multivesicular body protein 3, mousemouse

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp3Q9CQ10 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Chmp3Q9CQ10 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Chmp3Q9CQ10 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Chmp3Q9CQ10 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Chmp3Q9CQ10 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Chmp3Q9CQ10 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Chmp3Q9CQ10 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Chmp3Q9CQ10 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Chmp3Q9CQ10 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Chmp3Q9CQ10 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Chmp3Q9CQ10 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Chmp3Q9CQ10 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Chmp3Q9CQ10 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Chmp3Q9CQ10 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Chmp3Q9CQ10 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Chmp3Q9CQ10 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Chmp3Q9CQ10 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Chmp3Q9CQ10 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Chmp3Q9CQ10 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Chmp3Q9CQ10 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Chmp3Q9CQ10 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Chmp3Q9CQ10 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Chmp3Q9CQ10 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Chmp3Q9CQ10 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Chmp3Q9CQ10 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Chmp3Q9CQ10 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Chmp3Q9CQ10 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Chmp3Q9CQ10 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Chmp3Q9CQ10 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Chmp3Q9CQ10 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Chmp3Q9CQ10 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Chmp3Q9CQ10 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Chmp3Q9CQ10 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Chmp3Q9CQ10 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Chmp3Q9CQ10 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Chmp3Q9CQ10 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Chmp3Q9CQ10 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Chmp3Q9CQ10 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Chmp3Q9CQ10 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Chmp3Q9CQ10 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Chmp3Q9CQ10 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Chmp3Q9CQ10 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Chmp3Q9CQ10 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Chmp3Q9CQ10 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Chmp3Q9CQ10 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Chmp3Q9CQ10 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Chmp3Q9CQ10 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Chmp3Q9CQ10 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Chmp3Q9CQ10 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Chmp3Q9CQ10 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Chmp3Q9CQ10 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Chmp3Q9CQ10 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Chmp3Q9CQ10 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Chmp3Q9CQ10 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Chmp3Q9CQ10 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Chmp3Q9CQ10 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Chmp3Q9CQ10 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Chmp3Q9CQ10 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Chmp3Q9CQ10 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Chmp3Q9CQ10 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Chmp3Q9CQ10 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Chmp3Q9CQ10 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Chmp3Q9CQ10 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Chmp3Q9CQ10 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Chmp3Q9CQ10 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Chmp3Q9CQ10 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Chmp3Q9CQ10 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Chmp3Q9CQ10 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Chmp3Q9CQ10 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Chmp3Q9CQ10 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Chmp3Q9CQ10 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Chmp3Q9CQ10 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Chmp3Q9CQ10 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Chmp3Q9CQ10 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Chmp3Q9CQ10 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Chmp3Q9CQ10 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Chmp3Q9CQ10 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Chmp3Q9CQ10 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Chmp3Q9CQ10 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Chmp3Q9CQ10 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Chmp3Q9CQ10 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Chmp3Q9CQ10 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Chmp3Q9CQ10 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Chmp3Q9CQ10 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Chmp3Q9CQ10 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Chmp3Q9CQ10 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Chmp3Q9CQ10 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Chmp3Q9CQ10 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Chmp3Q9CQ10 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Chmp3Q9CQ10 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Chmp3Q9CQ10 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Chmp3Q9CQ10 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Chmp3Q9CQ10 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Chmp3Q9CQ10 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Chmp3Q9CQ10 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Chmp3Q9CQ10 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Chmp3Q9CQ10 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Chmp3Q9CQ10 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Chmp3Q9CQ10 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Chmp3Q9CQ10 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
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