Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Atg3Q9CPX6 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Atg3Q9CPX6 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Atg3Q9CPX6 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Atg3Q9CPX6 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Atg3Q9CPX6 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Atg3Q9CPX6 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Atg3Q9CPX6 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Atg3Q9CPX6 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Atg3Q9CPX6 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Atg3Q9CPX6 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Atg3Q9CPX6 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Atg3Q9CPX6 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Atg3Q9CPX6 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Atg3Q9CPX6 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Atg3Q9CPX6 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Atg3Q9CPX6 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Atg3Q9CPX6 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Atg3Q9CPX6 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Atg3Q9CPX6 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Atg3Q9CPX6 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Atg3Q9CPX6 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Atg3Q9CPX6 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Atg3Q9CPX6 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Atg3Q9CPX6 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Atg3Q9CPX6 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Atg3Q9CPX6 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Atg3Q9CPX6 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Atg3Q9CPX6 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Atg3Q9CPX6 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Atg3Q9CPX6 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Atg3Q9CPX6 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Atg3Q9CPX6 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Atg3Q9CPX6 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Atg3Q9CPX6 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Atg3Q9CPX6 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Atg3Q9CPX6 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Atg3Q9CPX6 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Atg3Q9CPX6 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Atg3Q9CPX6 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Atg3Q9CPX6 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Atg3Q9CPX6 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Atg3Q9CPX6 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Atg3Q9CPX6 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Atg3Q9CPX6 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Atg3Q9CPX6 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Atg3Q9CPX6 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Atg3Q9CPX6 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Atg3Q9CPX6 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Atg3Q9CPX6 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Atg3Q9CPX6 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Atg3Q9CPX6 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Atg3Q9CPX6 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Atg3Q9CPX6 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Atg3Q9CPX6 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Atg3Q9CPX6 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Atg3Q9CPX6 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Atg3Q9CPX6 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Atg3Q9CPX6 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Atg3Q9CPX6 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Atg3Q9CPX6 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Atg3Q9CPX6 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Atg3Q9CPX6 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Atg3Q9CPX6 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Atg3Q9CPX6 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Atg3Q9CPX6 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Atg3Q9CPX6 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Atg3Q9CPX6 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Atg3Q9CPX6 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Atg3Q9CPX6 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Atg3Q9CPX6 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Atg3Q9CPX6 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Atg3Q9CPX6 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Atg3Q9CPX6 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Atg3Q9CPX6 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Atg3Q9CPX6 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Atg3Q9CPX6 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Atg3Q9CPX6 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Atg3Q9CPX6 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Atg3Q9CPX6 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Atg3Q9CPX6 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Atg3Q9CPX6 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Atg3Q9CPX6 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Atg3Q9CPX6 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Atg3Q9CPX6 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Atg3Q9CPX6 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Atg3Q9CPX6 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Atg3Q9CPX6 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Atg3Q9CPX6 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Atg3Q9CPX6 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Atg3Q9CPX6 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Atg3Q9CPX6 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Atg3Q9CPX6 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Atg3Q9CPX6 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Atg3Q9CPX6 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Atg3Q9CPX6 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Atg3Q9CPX6 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Atg3Q9CPX6 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Atg3Q9CPX6 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Atg3Q9CPX6 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms