Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPU1

Ssxb1, MCG116417, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb1Q9CPU1 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ssxb1Q9CPU1 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ssxb1Q9CPU1 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ssxb1Q9CPU1 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ssxb1Q9CPU1 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ssxb1Q9CPU1 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ssxb1Q9CPU1 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ssxb1Q9CPU1 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ssxb1Q9CPU1 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ssxb1Q9CPU1 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ssxb1Q9CPU1 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ssxb1Q9CPU1 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ssxb1Q9CPU1 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ssxb1Q9CPU1 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ssxb1Q9CPU1 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ssxb1Q9CPU1 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ssxb1Q9CPU1 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ssxb1Q9CPU1 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ssxb1Q9CPU1 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ssxb1Q9CPU1 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ssxb1Q9CPU1 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ssxb1Q9CPU1 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ssxb1Q9CPU1 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ssxb1Q9CPU1 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ssxb1Q9CPU1 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ssxb1Q9CPU1 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ssxb1Q9CPU1 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ssxb1Q9CPU1 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ssxb1Q9CPU1 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ssxb1Q9CPU1 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ssxb1Q9CPU1 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ssxb1Q9CPU1 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ssxb1Q9CPU1 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ssxb1Q9CPU1 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ssxb1Q9CPU1 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ssxb1Q9CPU1 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ssxb1Q9CPU1 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ssxb1Q9CPU1 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ssxb1Q9CPU1 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ssxb1Q9CPU1 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ssxb1Q9CPU1 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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Ssxb1Q9CPU1 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ssxb1Q9CPU1 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ssxb1Q9CPU1 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Ssxb1Q9CPU1 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ssxb1Q9CPU1 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Ssxb1Q9CPU1 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ssxb1Q9CPU1 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Ssxb1Q9CPU1 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ssxb1Q9CPU1 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Ssxb1Q9CPU1 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ssxb1Q9CPU1 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ssxb1Q9CPU1 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ssxb1Q9CPU1 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Ssxb1Q9CPU1 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ssxb1Q9CPU1 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ssxb1Q9CPU1 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ssxb1Q9CPU1 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ssxb1Q9CPU1 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ssxb1Q9CPU1 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ssxb1Q9CPU1 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Ssxb1Q9CPU1 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ssxb1Q9CPU1 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ssxb1Q9CPU1 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ssxb1Q9CPU1 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ssxb1Q9CPU1 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ssxb1Q9CPU1 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ssxb1Q9CPU1 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ssxb1Q9CPU1 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ssxb1Q9CPU1 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ssxb1Q9CPU1 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ssxb1Q9CPU1 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ssxb1Q9CPU1 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ssxb1Q9CPU1 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ssxb1Q9CPU1 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ssxb1Q9CPU1 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ssxb1Q9CPU1 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ssxb1Q9CPU1 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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