Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR6

Krt88, Keratin 88, mousemouse

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Length 171 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt88Q9CPR6 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Krt88Q9CPR6 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Krt88Q9CPR6 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Krt88Q9CPR6 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Krt88Q9CPR6 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Krt88Q9CPR6 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Krt88Q9CPR6 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Krt88Q9CPR6 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Krt88Q9CPR6 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Krt88Q9CPR6 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Krt88Q9CPR6 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Krt88Q9CPR6 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Krt88Q9CPR6 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Krt88Q9CPR6 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Krt88Q9CPR6 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Krt88Q9CPR6 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Krt88Q9CPR6 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Krt88Q9CPR6 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Krt88Q9CPR6 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Krt88Q9CPR6 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Krt88Q9CPR6 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Krt88Q9CPR6 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Krt88Q9CPR6 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Krt88Q9CPR6 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Krt88Q9CPR6 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Krt88Q9CPR6 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Krt88Q9CPR6 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Krt88Q9CPR6 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Krt88Q9CPR6 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Krt88Q9CPR6 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Krt88Q9CPR6 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Krt88Q9CPR6 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Krt88Q9CPR6 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Krt88Q9CPR6 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Krt88Q9CPR6 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Krt88Q9CPR6 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Krt88Q9CPR6 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Krt88Q9CPR6 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Krt88Q9CPR6 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Krt88Q9CPR6 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Krt88Q9CPR6 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Krt88Q9CPR6 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Krt88Q9CPR6 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Krt88Q9CPR6 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Krt88Q9CPR6 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Krt88Q9CPR6 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Krt88Q9CPR6 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Krt88Q9CPR6 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Krt88Q9CPR6 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Krt88Q9CPR6 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Krt88Q9CPR6 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Krt88Q9CPR6 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Krt88Q9CPR6 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Krt88Q9CPR6 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Krt88Q9CPR6 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Krt88Q9CPR6 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Krt88Q9CPR6 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Krt88Q9CPR6 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Krt88Q9CPR6 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Krt88Q9CPR6 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Krt88Q9CPR6 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Krt88Q9CPR6 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Krt88Q9CPR6 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Krt88Q9CPR6 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Krt88Q9CPR6 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Krt88Q9CPR6 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Krt88Q9CPR6 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Krt88Q9CPR6 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Krt88Q9CPR6 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Krt88Q9CPR6 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Krt88Q9CPR6 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Krt88Q9CPR6 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Krt88Q9CPR6 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Krt88Q9CPR6 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Krt88Q9CPR6 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Krt88Q9CPR6 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Krt88Q9CPR6 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Krt88Q9CPR6 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Krt88Q9CPR6 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Krt88Q9CPR6 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Krt88Q9CPR6 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Krt88Q9CPR6 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Krt88Q9CPR6 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Krt88Q9CPR6 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Krt88Q9CPR6 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Krt88Q9CPR6 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Krt88Q9CPR6 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Krt88Q9CPR6 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Krt88Q9CPR6 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Krt88Q9CPR6 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Krt88Q9CPR6 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Krt88Q9CPR6 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Krt88Q9CPR6 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Krt88Q9CPR6 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Krt88Q9CPR6 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Krt88Q9CPR6 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Krt88Q9CPR6 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Krt88Q9CPR6 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Krt88Q9CPR6 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Krt88Q9CPR6 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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