Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV0

Prpf8, Pre-mRNA-processing-splicing factor 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf8Q99PV0 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Prpf8Q99PV0 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Prpf8Q99PV0 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Prpf8Q99PV0 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Prpf8Q99PV0 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Prpf8Q99PV0 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Prpf8Q99PV0 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Prpf8Q99PV0 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Prpf8Q99PV0 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Prpf8Q99PV0 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Prpf8Q99PV0 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Prpf8Q99PV0 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Prpf8Q99PV0 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Prpf8Q99PV0 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Prpf8Q99PV0 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Prpf8Q99PV0 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Prpf8Q99PV0 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Prpf8Q99PV0 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Prpf8Q99PV0 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Prpf8Q99PV0 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Prpf8Q99PV0 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Prpf8Q99PV0 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Prpf8Q99PV0 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Prpf8Q99PV0 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Prpf8Q99PV0 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Prpf8Q99PV0 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Prpf8Q99PV0 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Prpf8Q99PV0 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Prpf8Q99PV0 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Prpf8Q99PV0 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Prpf8Q99PV0 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Prpf8Q99PV0 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Prpf8Q99PV0 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Prpf8Q99PV0 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Prpf8Q99PV0 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Prpf8Q99PV0 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Prpf8Q99PV0 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Prpf8Q99PV0 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Prpf8Q99PV0 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Prpf8Q99PV0 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Prpf8Q99PV0 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Prpf8Q99PV0 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Prpf8Q99PV0 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Prpf8Q99PV0 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Prpf8Q99PV0 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Prpf8Q99PV0 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Prpf8Q99PV0 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Prpf8Q99PV0 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Prpf8Q99PV0 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Prpf8Q99PV0 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Prpf8Q99PV0 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Prpf8Q99PV0 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Prpf8Q99PV0 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Prpf8Q99PV0 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Prpf8Q99PV0 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Prpf8Q99PV0 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Prpf8Q99PV0 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Prpf8Q99PV0 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Prpf8Q99PV0 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Prpf8Q99PV0 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Prpf8Q99PV0 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Prpf8Q99PV0 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Prpf8Q99PV0 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Prpf8Q99PV0 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Prpf8Q99PV0 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Prpf8Q99PV0 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Prpf8Q99PV0 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Prpf8Q99PV0 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Prpf8Q99PV0 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Prpf8Q99PV0 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Prpf8Q99PV0 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Prpf8Q99PV0 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Prpf8Q99PV0 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Prpf8Q99PV0 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Prpf8Q99PV0 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Prpf8Q99PV0 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Prpf8Q99PV0 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Prpf8Q99PV0 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Prpf8Q99PV0 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Prpf8Q99PV0 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Prpf8Q99PV0 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Prpf8Q99PV0 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Prpf8Q99PV0 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Prpf8Q99PV0 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Prpf8Q99PV0 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Prpf8Q99PV0 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Prpf8Q99PV0 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Prpf8Q99PV0 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Prpf8Q99PV0 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Prpf8Q99PV0 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Prpf8Q99PV0 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Prpf8Q99PV0 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Prpf8Q99PV0 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Prpf8Q99PV0 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Prpf8Q99PV0 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Prpf8Q99PV0 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Prpf8Q99PV0 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Prpf8Q99PV0 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Prpf8Q99PV0 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Prpf8Q99PV0 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms