Protein–RNA interactions for Protein: Q99PH1

Lrrc4, Leucine-rich repeat-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 652 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc4Q99PH1 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrc4Q99PH1 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrc4Q99PH1 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrc4Q99PH1 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrc4Q99PH1 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrc4Q99PH1 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrc4Q99PH1 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrc4Q99PH1 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrc4Q99PH1 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrc4Q99PH1 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrc4Q99PH1 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrc4Q99PH1 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrc4Q99PH1 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrc4Q99PH1 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrc4Q99PH1 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrc4Q99PH1 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrc4Q99PH1 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrc4Q99PH1 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrc4Q99PH1 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrc4Q99PH1 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrc4Q99PH1 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrc4Q99PH1 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrc4Q99PH1 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrc4Q99PH1 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrc4Q99PH1 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrc4Q99PH1 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrc4Q99PH1 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrc4Q99PH1 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrc4Q99PH1 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrc4Q99PH1 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrc4Q99PH1 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrc4Q99PH1 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrc4Q99PH1 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrc4Q99PH1 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrc4Q99PH1 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrc4Q99PH1 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrc4Q99PH1 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrc4Q99PH1 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrc4Q99PH1 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrc4Q99PH1 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrc4Q99PH1 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrc4Q99PH1 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrc4Q99PH1 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrc4Q99PH1 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrc4Q99PH1 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrc4Q99PH1 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrc4Q99PH1 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrc4Q99PH1 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrc4Q99PH1 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrc4Q99PH1 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrc4Q99PH1 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrc4Q99PH1 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrc4Q99PH1 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrc4Q99PH1 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrc4Q99PH1 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrc4Q99PH1 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrc4Q99PH1 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrc4Q99PH1 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrc4Q99PH1 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrc4Q99PH1 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrc4Q99PH1 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrc4Q99PH1 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrc4Q99PH1 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrc4Q99PH1 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrc4Q99PH1 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrc4Q99PH1 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrc4Q99PH1 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrc4Q99PH1 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrc4Q99PH1 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrc4Q99PH1 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrc4Q99PH1 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrc4Q99PH1 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrc4Q99PH1 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrc4Q99PH1 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrc4Q99PH1 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrc4Q99PH1 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrc4Q99PH1 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrc4Q99PH1 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrc4Q99PH1 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrc4Q99PH1 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrc4Q99PH1 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrc4Q99PH1 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrc4Q99PH1 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrc4Q99PH1 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrc4Q99PH1 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrc4Q99PH1 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrc4Q99PH1 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrc4Q99PH1 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrc4Q99PH1 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrc4Q99PH1 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrc4Q99PH1 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrc4Q99PH1 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrc4Q99PH1 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrc4Q99PH1 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrc4Q99PH1 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrc4Q99PH1 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrc4Q99PH1 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrc4Q99PH1 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrc4Q99PH1 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrc4Q99PH1 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms