Protein–RNA interactions for Protein: Q99NH8

Trem2, Triggering receptor expressed on myeloid cells 2, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trem2Q99NH8 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trem2Q99NH8 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trem2Q99NH8 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trem2Q99NH8 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trem2Q99NH8 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trem2Q99NH8 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trem2Q99NH8 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trem2Q99NH8 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trem2Q99NH8 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trem2Q99NH8 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trem2Q99NH8 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trem2Q99NH8 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trem2Q99NH8 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trem2Q99NH8 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trem2Q99NH8 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trem2Q99NH8 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trem2Q99NH8 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trem2Q99NH8 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trem2Q99NH8 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trem2Q99NH8 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trem2Q99NH8 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Trem2Q99NH8 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trem2Q99NH8 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trem2Q99NH8 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Trem2Q99NH8 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trem2Q99NH8 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trem2Q99NH8 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trem2Q99NH8 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trem2Q99NH8 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trem2Q99NH8 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trem2Q99NH8 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trem2Q99NH8 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trem2Q99NH8 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Trem2Q99NH8 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Trem2Q99NH8 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trem2Q99NH8 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Trem2Q99NH8 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trem2Q99NH8 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trem2Q99NH8 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trem2Q99NH8 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trem2Q99NH8 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trem2Q99NH8 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trem2Q99NH8 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trem2Q99NH8 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trem2Q99NH8 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trem2Q99NH8 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trem2Q99NH8 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trem2Q99NH8 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trem2Q99NH8 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trem2Q99NH8 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trem2Q99NH8 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trem2Q99NH8 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Trem2Q99NH8 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trem2Q99NH8 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trem2Q99NH8 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trem2Q99NH8 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trem2Q99NH8 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trem2Q99NH8 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trem2Q99NH8 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trem2Q99NH8 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trem2Q99NH8 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trem2Q99NH8 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trem2Q99NH8 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trem2Q99NH8 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trem2Q99NH8 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trem2Q99NH8 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trem2Q99NH8 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trem2Q99NH8 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trem2Q99NH8 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trem2Q99NH8 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Trem2Q99NH8 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trem2Q99NH8 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Trem2Q99NH8 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trem2Q99NH8 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trem2Q99NH8 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Trem2Q99NH8 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trem2Q99NH8 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trem2Q99NH8 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trem2Q99NH8 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trem2Q99NH8 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trem2Q99NH8 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trem2Q99NH8 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trem2Q99NH8 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trem2Q99NH8 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trem2Q99NH8 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trem2Q99NH8 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trem2Q99NH8 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trem2Q99NH8 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trem2Q99NH8 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trem2Q99NH8 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trem2Q99NH8 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trem2Q99NH8 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trem2Q99NH8 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trem2Q99NH8 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trem2Q99NH8 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trem2Q99NH8 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trem2Q99NH8 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trem2Q99NH8 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trem2Q99NH8 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trem2Q99NH8 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms