Protein–RNA interactions for Protein: Q99NE5

Rims1, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rims1Q99NE5 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Rims1Q99NE5 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rims1Q99NE5 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rims1Q99NE5 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Rims1Q99NE5 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rims1Q99NE5 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rims1Q99NE5 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rims1Q99NE5 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rims1Q99NE5 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rims1Q99NE5 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rims1Q99NE5 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Rims1Q99NE5 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rims1Q99NE5 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rims1Q99NE5 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rims1Q99NE5 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rims1Q99NE5 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rims1Q99NE5 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rims1Q99NE5 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rims1Q99NE5 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rims1Q99NE5 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rims1Q99NE5 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rims1Q99NE5 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rims1Q99NE5 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rims1Q99NE5 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rims1Q99NE5 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rims1Q99NE5 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rims1Q99NE5 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rims1Q99NE5 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rims1Q99NE5 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Rims1Q99NE5 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rims1Q99NE5 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rims1Q99NE5 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rims1Q99NE5 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rims1Q99NE5 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rims1Q99NE5 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rims1Q99NE5 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rims1Q99NE5 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rims1Q99NE5 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rims1Q99NE5 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rims1Q99NE5 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rims1Q99NE5 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rims1Q99NE5 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rims1Q99NE5 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rims1Q99NE5 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Rims1Q99NE5 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rims1Q99NE5 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rims1Q99NE5 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rims1Q99NE5 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rims1Q99NE5 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rims1Q99NE5 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rims1Q99NE5 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rims1Q99NE5 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rims1Q99NE5 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rims1Q99NE5 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rims1Q99NE5 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Rims1Q99NE5 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rims1Q99NE5 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rims1Q99NE5 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rims1Q99NE5 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rims1Q99NE5 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rims1Q99NE5 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rims1Q99NE5 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rims1Q99NE5 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rims1Q99NE5 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rims1Q99NE5 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rims1Q99NE5 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rims1Q99NE5 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rims1Q99NE5 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Rims1Q99NE5 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Rims1Q99NE5 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rims1Q99NE5 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rims1Q99NE5 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rims1Q99NE5 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rims1Q99NE5 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rims1Q99NE5 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rims1Q99NE5 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rims1Q99NE5 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rims1Q99NE5 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rims1Q99NE5 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rims1Q99NE5 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rims1Q99NE5 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Rims1Q99NE5 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rims1Q99NE5 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rims1Q99NE5 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rims1Q99NE5 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rims1Q99NE5 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rims1Q99NE5 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rims1Q99NE5 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rims1Q99NE5 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rims1Q99NE5 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rims1Q99NE5 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rims1Q99NE5 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rims1Q99NE5 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rims1Q99NE5 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rims1Q99NE5 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Rims1Q99NE5 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rims1Q99NE5 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rims1Q99NE5 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rims1Q99NE5 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rims1Q99NE5 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.8 ms