Protein–RNA interactions for Protein: Q99N89

Mrpl43, 39S ribosomal protein L43, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl43Q99N89 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mrpl43Q99N89 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mrpl43Q99N89 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mrpl43Q99N89 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mrpl43Q99N89 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mrpl43Q99N89 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Mrpl43Q99N89 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mrpl43Q99N89 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mrpl43Q99N89 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mrpl43Q99N89 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mrpl43Q99N89 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mrpl43Q99N89 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mrpl43Q99N89 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mrpl43Q99N89 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mrpl43Q99N89 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mrpl43Q99N89 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mrpl43Q99N89 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Mrpl43Q99N89 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Mrpl43Q99N89 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Mrpl43Q99N89 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Mrpl43Q99N89 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Mrpl43Q99N89 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Mrpl43Q99N89 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Mrpl43Q99N89 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Mrpl43Q99N89 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Mrpl43Q99N89 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Mrpl43Q99N89 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Mrpl43Q99N89 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Mrpl43Q99N89 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Mrpl43Q99N89 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Mrpl43Q99N89 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Mrpl43Q99N89 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Mrpl43Q99N89 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mrpl43Q99N89 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mrpl43Q99N89 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Mrpl43Q99N89 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Mrpl43Q99N89 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mrpl43Q99N89 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mrpl43Q99N89 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mrpl43Q99N89 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mrpl43Q99N89 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Mrpl43Q99N89 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Mrpl43Q99N89 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mrpl43Q99N89 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mrpl43Q99N89 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mrpl43Q99N89 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mrpl43Q99N89 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mrpl43Q99N89 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mrpl43Q99N89 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mrpl43Q99N89 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mrpl43Q99N89 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Mrpl43Q99N89 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mrpl43Q99N89 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mrpl43Q99N89 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mrpl43Q99N89 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mrpl43Q99N89 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mrpl43Q99N89 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mrpl43Q99N89 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mrpl43Q99N89 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mrpl43Q99N89 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mrpl43Q99N89 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Mrpl43Q99N89 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Mrpl43Q99N89 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.03
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