Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

Predictions only

Length 1,454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PtprtQ99M80 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
PtprtQ99M80 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
PtprtQ99M80 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
PtprtQ99M80 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
PtprtQ99M80 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PtprtQ99M80 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PtprtQ99M80 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PtprtQ99M80 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PtprtQ99M80 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
PtprtQ99M80 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PtprtQ99M80 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PtprtQ99M80 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PtprtQ99M80 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
PtprtQ99M80 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PtprtQ99M80 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PtprtQ99M80 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PtprtQ99M80 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PtprtQ99M80 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PtprtQ99M80 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PtprtQ99M80 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PtprtQ99M80 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PtprtQ99M80 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PtprtQ99M80 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PtprtQ99M80 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PtprtQ99M80 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PtprtQ99M80 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PtprtQ99M80 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PtprtQ99M80 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PtprtQ99M80 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
PtprtQ99M80 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PtprtQ99M80 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PtprtQ99M80 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PtprtQ99M80 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PtprtQ99M80 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PtprtQ99M80 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PtprtQ99M80 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PtprtQ99M80 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PtprtQ99M80 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PtprtQ99M80 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PtprtQ99M80 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PtprtQ99M80 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PtprtQ99M80 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PtprtQ99M80 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PtprtQ99M80 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PtprtQ99M80 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PtprtQ99M80 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PtprtQ99M80 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PtprtQ99M80 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PtprtQ99M80 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PtprtQ99M80 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PtprtQ99M80 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PtprtQ99M80 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PtprtQ99M80 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PtprtQ99M80 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
PtprtQ99M80 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PtprtQ99M80 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
PtprtQ99M80 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PtprtQ99M80 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PtprtQ99M80 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PtprtQ99M80 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PtprtQ99M80 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
PtprtQ99M80 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PtprtQ99M80 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PtprtQ99M80 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PtprtQ99M80 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PtprtQ99M80 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
PtprtQ99M80 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PtprtQ99M80 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PtprtQ99M80 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PtprtQ99M80 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PtprtQ99M80 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PtprtQ99M80 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PtprtQ99M80 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PtprtQ99M80 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PtprtQ99M80 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PtprtQ99M80 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PtprtQ99M80 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PtprtQ99M80 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PtprtQ99M80 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PtprtQ99M80 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PtprtQ99M80 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PtprtQ99M80 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PtprtQ99M80 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PtprtQ99M80 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PtprtQ99M80 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PtprtQ99M80 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PtprtQ99M80 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
PtprtQ99M80 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
PtprtQ99M80 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PtprtQ99M80 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PtprtQ99M80 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PtprtQ99M80 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PtprtQ99M80 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PtprtQ99M80 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PtprtQ99M80 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PtprtQ99M80 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PtprtQ99M80 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PtprtQ99M80 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PtprtQ99M80 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms