Protein–RNA interactions for Protein: Q99L48

Nmd3, 60S ribosomal export protein NMD3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nmd3Q99L48 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nmd3Q99L48 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nmd3Q99L48 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Nmd3Q99L48 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nmd3Q99L48 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nmd3Q99L48 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nmd3Q99L48 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nmd3Q99L48 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nmd3Q99L48 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nmd3Q99L48 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Nmd3Q99L48 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Nmd3Q99L48 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Nmd3Q99L48 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nmd3Q99L48 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nmd3Q99L48 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nmd3Q99L48 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nmd3Q99L48 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nmd3Q99L48 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nmd3Q99L48 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nmd3Q99L48 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nmd3Q99L48 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nmd3Q99L48 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nmd3Q99L48 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nmd3Q99L48 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nmd3Q99L48 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nmd3Q99L48 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nmd3Q99L48 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nmd3Q99L48 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nmd3Q99L48 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nmd3Q99L48 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nmd3Q99L48 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nmd3Q99L48 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nmd3Q99L48 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nmd3Q99L48 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nmd3Q99L48 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nmd3Q99L48 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nmd3Q99L48 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nmd3Q99L48 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nmd3Q99L48 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nmd3Q99L48 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nmd3Q99L48 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nmd3Q99L48 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nmd3Q99L48 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nmd3Q99L48 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nmd3Q99L48 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nmd3Q99L48 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nmd3Q99L48 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nmd3Q99L48 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Nmd3Q99L48 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nmd3Q99L48 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nmd3Q99L48 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nmd3Q99L48 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nmd3Q99L48 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nmd3Q99L48 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nmd3Q99L48 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Nmd3Q99L48 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nmd3Q99L48 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nmd3Q99L48 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nmd3Q99L48 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nmd3Q99L48 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nmd3Q99L48 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nmd3Q99L48 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nmd3Q99L48 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nmd3Q99L48 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nmd3Q99L48 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Nmd3Q99L48 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Nmd3Q99L48 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nmd3Q99L48 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nmd3Q99L48 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nmd3Q99L48 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nmd3Q99L48 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nmd3Q99L48 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nmd3Q99L48 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nmd3Q99L48 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nmd3Q99L48 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Nmd3Q99L48 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nmd3Q99L48 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nmd3Q99L48 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nmd3Q99L48 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nmd3Q99L48 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nmd3Q99L48 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nmd3Q99L48 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nmd3Q99L48 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nmd3Q99L48 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Nmd3Q99L48 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nmd3Q99L48 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nmd3Q99L48 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nmd3Q99L48 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nmd3Q99L48 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nmd3Q99L48 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nmd3Q99L48 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nmd3Q99L48 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nmd3Q99L48 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nmd3Q99L48 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nmd3Q99L48 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nmd3Q99L48 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nmd3Q99L48 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nmd3Q99L48 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nmd3Q99L48 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nmd3Q99L48 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms