Protein–RNA interactions for Protein: Q99KU1

Dhdds, Dehydrodolichyl diphosphate synthase complex subunit Dhdds, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DhddsQ99KU1 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DhddsQ99KU1 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DhddsQ99KU1 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DhddsQ99KU1 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DhddsQ99KU1 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DhddsQ99KU1 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DhddsQ99KU1 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DhddsQ99KU1 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DhddsQ99KU1 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DhddsQ99KU1 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DhddsQ99KU1 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DhddsQ99KU1 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DhddsQ99KU1 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DhddsQ99KU1 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DhddsQ99KU1 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DhddsQ99KU1 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DhddsQ99KU1 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
DhddsQ99KU1 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DhddsQ99KU1 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DhddsQ99KU1 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DhddsQ99KU1 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DhddsQ99KU1 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DhddsQ99KU1 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DhddsQ99KU1 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DhddsQ99KU1 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DhddsQ99KU1 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DhddsQ99KU1 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DhddsQ99KU1 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DhddsQ99KU1 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DhddsQ99KU1 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DhddsQ99KU1 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DhddsQ99KU1 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DhddsQ99KU1 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DhddsQ99KU1 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DhddsQ99KU1 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DhddsQ99KU1 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DhddsQ99KU1 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DhddsQ99KU1 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DhddsQ99KU1 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DhddsQ99KU1 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DhddsQ99KU1 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DhddsQ99KU1 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DhddsQ99KU1 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DhddsQ99KU1 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DhddsQ99KU1 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DhddsQ99KU1 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
DhddsQ99KU1 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
DhddsQ99KU1 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
DhddsQ99KU1 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
DhddsQ99KU1 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
DhddsQ99KU1 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
DhddsQ99KU1 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DhddsQ99KU1 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DhddsQ99KU1 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DhddsQ99KU1 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DhddsQ99KU1 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DhddsQ99KU1 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DhddsQ99KU1 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DhddsQ99KU1 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DhddsQ99KU1 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
DhddsQ99KU1 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
DhddsQ99KU1 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DhddsQ99KU1 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DhddsQ99KU1 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
DhddsQ99KU1 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DhddsQ99KU1 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DhddsQ99KU1 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DhddsQ99KU1 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DhddsQ99KU1 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DhddsQ99KU1 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DhddsQ99KU1 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DhddsQ99KU1 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DhddsQ99KU1 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DhddsQ99KU1 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DhddsQ99KU1 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DhddsQ99KU1 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
DhddsQ99KU1 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
DhddsQ99KU1 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
DhddsQ99KU1 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
DhddsQ99KU1 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
DhddsQ99KU1 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
DhddsQ99KU1 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
DhddsQ99KU1 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
DhddsQ99KU1 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
DhddsQ99KU1 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
DhddsQ99KU1 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
DhddsQ99KU1 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
DhddsQ99KU1 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
DhddsQ99KU1 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
DhddsQ99KU1 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
DhddsQ99KU1 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
DhddsQ99KU1 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
DhddsQ99KU1 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
DhddsQ99KU1 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
DhddsQ99KU1 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
DhddsQ99KU1 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
DhddsQ99KU1 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
DhddsQ99KU1 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
DhddsQ99KU1 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
DhddsQ99KU1 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms