Protein–RNA interactions for Protein: Q99KU0

Vmp1, Vacuole membrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmp1Q99KU0 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmp1Q99KU0 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmp1Q99KU0 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmp1Q99KU0 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmp1Q99KU0 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmp1Q99KU0 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmp1Q99KU0 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmp1Q99KU0 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmp1Q99KU0 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmp1Q99KU0 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmp1Q99KU0 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmp1Q99KU0 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmp1Q99KU0 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmp1Q99KU0 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmp1Q99KU0 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmp1Q99KU0 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmp1Q99KU0 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Vmp1Q99KU0 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Vmp1Q99KU0 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Vmp1Q99KU0 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Vmp1Q99KU0 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmp1Q99KU0 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmp1Q99KU0 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmp1Q99KU0 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmp1Q99KU0 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmp1Q99KU0 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmp1Q99KU0 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmp1Q99KU0 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmp1Q99KU0 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmp1Q99KU0 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmp1Q99KU0 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmp1Q99KU0 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmp1Q99KU0 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmp1Q99KU0 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmp1Q99KU0 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmp1Q99KU0 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmp1Q99KU0 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmp1Q99KU0 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmp1Q99KU0 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmp1Q99KU0 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmp1Q99KU0 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmp1Q99KU0 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmp1Q99KU0 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmp1Q99KU0 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmp1Q99KU0 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmp1Q99KU0 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmp1Q99KU0 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmp1Q99KU0 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmp1Q99KU0 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmp1Q99KU0 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmp1Q99KU0 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmp1Q99KU0 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmp1Q99KU0 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmp1Q99KU0 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmp1Q99KU0 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmp1Q99KU0 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmp1Q99KU0 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmp1Q99KU0 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmp1Q99KU0 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmp1Q99KU0 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmp1Q99KU0 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmp1Q99KU0 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmp1Q99KU0 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmp1Q99KU0 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmp1Q99KU0 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmp1Q99KU0 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmp1Q99KU0 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmp1Q99KU0 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmp1Q99KU0 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmp1Q99KU0 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmp1Q99KU0 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmp1Q99KU0 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmp1Q99KU0 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmp1Q99KU0 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmp1Q99KU0 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmp1Q99KU0 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmp1Q99KU0 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmp1Q99KU0 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmp1Q99KU0 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmp1Q99KU0 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmp1Q99KU0 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmp1Q99KU0 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmp1Q99KU0 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmp1Q99KU0 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmp1Q99KU0 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmp1Q99KU0 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmp1Q99KU0 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmp1Q99KU0 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmp1Q99KU0 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmp1Q99KU0 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmp1Q99KU0 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmp1Q99KU0 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmp1Q99KU0 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmp1Q99KU0 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmp1Q99KU0 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmp1Q99KU0 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmp1Q99KU0 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmp1Q99KU0 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmp1Q99KU0 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmp1Q99KU0 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms