Protein–RNA interactions for Protein: Q99KC7

Smagp, Small cell adhesion glycoprotein, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmagpQ99KC7 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
SmagpQ99KC7 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
SmagpQ99KC7 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
SmagpQ99KC7 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
SmagpQ99KC7 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
SmagpQ99KC7 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
SmagpQ99KC7 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC12.6□□□□□ -0.39
SmagpQ99KC7 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
SmagpQ99KC7 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SmagpQ99KC7 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SmagpQ99KC7 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SmagpQ99KC7 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SmagpQ99KC7 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SmagpQ99KC7 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SmagpQ99KC7 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SmagpQ99KC7 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
SmagpQ99KC7 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
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SmagpQ99KC7 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
SmagpQ99KC7 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SmagpQ99KC7 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SmagpQ99KC7 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
SmagpQ99KC7 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SmagpQ99KC7 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SmagpQ99KC7 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
SmagpQ99KC7 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SmagpQ99KC7 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SmagpQ99KC7 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
SmagpQ99KC7 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SmagpQ99KC7 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SmagpQ99KC7 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SmagpQ99KC7 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SmagpQ99KC7 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SmagpQ99KC7 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SmagpQ99KC7 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SmagpQ99KC7 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SmagpQ99KC7 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SmagpQ99KC7 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SmagpQ99KC7 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
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SmagpQ99KC7 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
SmagpQ99KC7 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SmagpQ99KC7 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
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SmagpQ99KC7 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
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SmagpQ99KC7 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SmagpQ99KC7 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
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SmagpQ99KC7 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SmagpQ99KC7 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SmagpQ99KC7 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SmagpQ99KC7 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SmagpQ99KC7 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SmagpQ99KC7 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SmagpQ99KC7 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
SmagpQ99KC7 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SmagpQ99KC7 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
SmagpQ99KC7 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
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SmagpQ99KC7 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
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SmagpQ99KC7 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
SmagpQ99KC7 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
SmagpQ99KC7 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
SmagpQ99KC7 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
SmagpQ99KC7 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
SmagpQ99KC7 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
SmagpQ99KC7 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
SmagpQ99KC7 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
SmagpQ99KC7 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
SmagpQ99KC7 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
SmagpQ99KC7 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
SmagpQ99KC7 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
SmagpQ99KC7 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
SmagpQ99KC7 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
SmagpQ99KC7 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
SmagpQ99KC7 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
SmagpQ99KC7 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
SmagpQ99KC7 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
SmagpQ99KC7 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
SmagpQ99KC7 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
SmagpQ99KC7 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
SmagpQ99KC7 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
SmagpQ99KC7 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
SmagpQ99KC7 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
SmagpQ99KC7 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
SmagpQ99KC7 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
SmagpQ99KC7 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
SmagpQ99KC7 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
SmagpQ99KC7 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
SmagpQ99KC7 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
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