Protein–RNA interactions for Protein: Q99JT5

Krcc1, Lysine-rich coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krcc1Q99JT5 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Krcc1Q99JT5 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Krcc1Q99JT5 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Krcc1Q99JT5 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Krcc1Q99JT5 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Krcc1Q99JT5 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Krcc1Q99JT5 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Krcc1Q99JT5 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Krcc1Q99JT5 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Krcc1Q99JT5 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Krcc1Q99JT5 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Krcc1Q99JT5 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Krcc1Q99JT5 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Krcc1Q99JT5 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Krcc1Q99JT5 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Krcc1Q99JT5 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Krcc1Q99JT5 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Krcc1Q99JT5 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Krcc1Q99JT5 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Krcc1Q99JT5 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Krcc1Q99JT5 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Krcc1Q99JT5 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Krcc1Q99JT5 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Krcc1Q99JT5 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Krcc1Q99JT5 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Krcc1Q99JT5 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Krcc1Q99JT5 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Krcc1Q99JT5 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Krcc1Q99JT5 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Krcc1Q99JT5 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Krcc1Q99JT5 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Krcc1Q99JT5 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Krcc1Q99JT5 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Krcc1Q99JT5 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Krcc1Q99JT5 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Krcc1Q99JT5 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Krcc1Q99JT5 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Krcc1Q99JT5 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Krcc1Q99JT5 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Krcc1Q99JT5 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Krcc1Q99JT5 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Krcc1Q99JT5 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Krcc1Q99JT5 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Krcc1Q99JT5 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Krcc1Q99JT5 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Krcc1Q99JT5 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Krcc1Q99JT5 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Krcc1Q99JT5 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Krcc1Q99JT5 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Krcc1Q99JT5 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Krcc1Q99JT5 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Krcc1Q99JT5 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Krcc1Q99JT5 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Krcc1Q99JT5 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Krcc1Q99JT5 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Krcc1Q99JT5 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Krcc1Q99JT5 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Krcc1Q99JT5 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Krcc1Q99JT5 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Krcc1Q99JT5 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Krcc1Q99JT5 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Krcc1Q99JT5 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Krcc1Q99JT5 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Krcc1Q99JT5 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Krcc1Q99JT5 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Krcc1Q99JT5 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Krcc1Q99JT5 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Krcc1Q99JT5 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Krcc1Q99JT5 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Krcc1Q99JT5 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Krcc1Q99JT5 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Krcc1Q99JT5 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Krcc1Q99JT5 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Krcc1Q99JT5 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Krcc1Q99JT5 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Krcc1Q99JT5 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Krcc1Q99JT5 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Krcc1Q99JT5 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Krcc1Q99JT5 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Krcc1Q99JT5 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Krcc1Q99JT5 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Krcc1Q99JT5 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Krcc1Q99JT5 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Krcc1Q99JT5 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Krcc1Q99JT5 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Krcc1Q99JT5 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Krcc1Q99JT5 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Krcc1Q99JT5 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Krcc1Q99JT5 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Krcc1Q99JT5 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Krcc1Q99JT5 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Krcc1Q99JT5 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Krcc1Q99JT5 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Krcc1Q99JT5 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Krcc1Q99JT5 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Krcc1Q99JT5 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Krcc1Q99JT5 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Krcc1Q99JT5 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Krcc1Q99JT5 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Krcc1Q99JT5 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62 ms