Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Apobec3Q99J72 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Apobec3Q99J72 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Apobec3Q99J72 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Apobec3Q99J72 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Apobec3Q99J72 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Apobec3Q99J72 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Apobec3Q99J72 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Apobec3Q99J72 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Apobec3Q99J72 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Apobec3Q99J72 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Apobec3Q99J72 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Apobec3Q99J72 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Apobec3Q99J72 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Apobec3Q99J72 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Apobec3Q99J72 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Apobec3Q99J72 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Apobec3Q99J72 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Apobec3Q99J72 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Apobec3Q99J72 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Apobec3Q99J72 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Apobec3Q99J72 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Apobec3Q99J72 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Apobec3Q99J72 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Apobec3Q99J72 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Apobec3Q99J72 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Apobec3Q99J72 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Apobec3Q99J72 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Apobec3Q99J72 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Apobec3Q99J72 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Apobec3Q99J72 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Apobec3Q99J72 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Apobec3Q99J72 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Apobec3Q99J72 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Apobec3Q99J72 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Apobec3Q99J72 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Apobec3Q99J72 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Apobec3Q99J72 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Apobec3Q99J72 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Apobec3Q99J72 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Apobec3Q99J72 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Apobec3Q99J72 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Apobec3Q99J72 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Apobec3Q99J72 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Apobec3Q99J72 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Apobec3Q99J72 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Apobec3Q99J72 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Apobec3Q99J72 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Apobec3Q99J72 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Apobec3Q99J72 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Apobec3Q99J72 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Apobec3Q99J72 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Apobec3Q99J72 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Apobec3Q99J72 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Apobec3Q99J72 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Apobec3Q99J72 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Apobec3Q99J72 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Apobec3Q99J72 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Apobec3Q99J72 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Apobec3Q99J72 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Apobec3Q99J72 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Apobec3Q99J72 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Apobec3Q99J72 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Apobec3Q99J72 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Apobec3Q99J72 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Apobec3Q99J72 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Apobec3Q99J72 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Apobec3Q99J72 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Apobec3Q99J72 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Apobec3Q99J72 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Apobec3Q99J72 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Apobec3Q99J72 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Apobec3Q99J72 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Apobec3Q99J72 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Apobec3Q99J72 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Apobec3Q99J72 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Apobec3Q99J72 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Apobec3Q99J72 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Apobec3Q99J72 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Apobec3Q99J72 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Apobec3Q99J72 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Apobec3Q99J72 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Apobec3Q99J72 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Apobec3Q99J72 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Apobec3Q99J72 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Apobec3Q99J72 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Apobec3Q99J72 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Apobec3Q99J72 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Apobec3Q99J72 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Apobec3Q99J72 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Apobec3Q99J72 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Apobec3Q99J72 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Apobec3Q99J72 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Apobec3Q99J72 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Apobec3Q99J72 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Apobec3Q99J72 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Apobec3Q99J72 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Apobec3Q99J72 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Apobec3Q99J72 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Apobec3Q99J72 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms