Protein–RNA interactions for Protein: Q99J59

Tspan1, Tetraspanin-1, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan1Q99J59 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tspan1Q99J59 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Tspan1Q99J59 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tspan1Q99J59 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tspan1Q99J59 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tspan1Q99J59 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tspan1Q99J59 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tspan1Q99J59 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tspan1Q99J59 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tspan1Q99J59 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tspan1Q99J59 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tspan1Q99J59 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tspan1Q99J59 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tspan1Q99J59 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tspan1Q99J59 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tspan1Q99J59 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tspan1Q99J59 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tspan1Q99J59 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tspan1Q99J59 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tspan1Q99J59 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tspan1Q99J59 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tspan1Q99J59 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tspan1Q99J59 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tspan1Q99J59 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tspan1Q99J59 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Tspan1Q99J59 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Tspan1Q99J59 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tspan1Q99J59 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Tspan1Q99J59 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tspan1Q99J59 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tspan1Q99J59 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tspan1Q99J59 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tspan1Q99J59 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tspan1Q99J59 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tspan1Q99J59 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tspan1Q99J59 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tspan1Q99J59 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tspan1Q99J59 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tspan1Q99J59 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tspan1Q99J59 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tspan1Q99J59 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tspan1Q99J59 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tspan1Q99J59 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tspan1Q99J59 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tspan1Q99J59 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Tspan1Q99J59 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tspan1Q99J59 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tspan1Q99J59 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tspan1Q99J59 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tspan1Q99J59 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tspan1Q99J59 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tspan1Q99J59 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tspan1Q99J59 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Tspan1Q99J59 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tspan1Q99J59 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tspan1Q99J59 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tspan1Q99J59 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tspan1Q99J59 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tspan1Q99J59 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tspan1Q99J59 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tspan1Q99J59 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tspan1Q99J59 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tspan1Q99J59 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tspan1Q99J59 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tspan1Q99J59 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tspan1Q99J59 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tspan1Q99J59 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tspan1Q99J59 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tspan1Q99J59 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tspan1Q99J59 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tspan1Q99J59 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tspan1Q99J59 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tspan1Q99J59 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tspan1Q99J59 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Tspan1Q99J59 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tspan1Q99J59 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tspan1Q99J59 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tspan1Q99J59 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Tspan1Q99J59 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tspan1Q99J59 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tspan1Q99J59 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tspan1Q99J59 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tspan1Q99J59 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tspan1Q99J59 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tspan1Q99J59 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tspan1Q99J59 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tspan1Q99J59 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tspan1Q99J59 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tspan1Q99J59 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tspan1Q99J59 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tspan1Q99J59 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Tspan1Q99J59 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tspan1Q99J59 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tspan1Q99J59 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tspan1Q99J59 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tspan1Q99J59 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tspan1Q99J59 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tspan1Q99J59 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tspan1Q99J59 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tspan1Q99J59 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms