Protein–RNA interactions for Protein: Q923T7

Trim7, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM7, mousemouse

Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim7Q923T7 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim7Q923T7 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim7Q923T7 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim7Q923T7 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim7Q923T7 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim7Q923T7 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim7Q923T7 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim7Q923T7 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim7Q923T7 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim7Q923T7 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim7Q923T7 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim7Q923T7 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim7Q923T7 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim7Q923T7 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim7Q923T7 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim7Q923T7 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim7Q923T7 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim7Q923T7 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim7Q923T7 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim7Q923T7 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim7Q923T7 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim7Q923T7 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim7Q923T7 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim7Q923T7 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim7Q923T7 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim7Q923T7 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim7Q923T7 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim7Q923T7 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim7Q923T7 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim7Q923T7 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim7Q923T7 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim7Q923T7 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim7Q923T7 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim7Q923T7 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim7Q923T7 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim7Q923T7 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim7Q923T7 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim7Q923T7 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim7Q923T7 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim7Q923T7 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim7Q923T7 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim7Q923T7 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim7Q923T7 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim7Q923T7 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim7Q923T7 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim7Q923T7 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim7Q923T7 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim7Q923T7 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim7Q923T7 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim7Q923T7 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim7Q923T7 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim7Q923T7 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim7Q923T7 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim7Q923T7 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim7Q923T7 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Trim7Q923T7 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Trim7Q923T7 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim7Q923T7 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim7Q923T7 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim7Q923T7 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim7Q923T7 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim7Q923T7 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim7Q923T7 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim7Q923T7 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim7Q923T7 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim7Q923T7 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim7Q923T7 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim7Q923T7 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim7Q923T7 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim7Q923T7 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim7Q923T7 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim7Q923T7 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim7Q923T7 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim7Q923T7 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim7Q923T7 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim7Q923T7 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim7Q923T7 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim7Q923T7 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim7Q923T7 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim7Q923T7 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim7Q923T7 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim7Q923T7 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim7Q923T7 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim7Q923T7 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim7Q923T7 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim7Q923T7 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim7Q923T7 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim7Q923T7 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim7Q923T7 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim7Q923T7 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim7Q923T7 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim7Q923T7 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim7Q923T7 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim7Q923T7 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim7Q923T7 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim7Q923T7 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim7Q923T7 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim7Q923T7 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim7Q923T7 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim7Q923T7 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms