Protein–RNA interactions for Protein: Q91YK0

Lrrc49, Leucine-rich repeat-containing protein 49, mousemouse

Predictions only

Length 686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc49Q91YK0 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrrc49Q91YK0 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrrc49Q91YK0 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrrc49Q91YK0 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrrc49Q91YK0 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrrc49Q91YK0 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrrc49Q91YK0 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrrc49Q91YK0 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrrc49Q91YK0 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrrc49Q91YK0 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrrc49Q91YK0 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrc49Q91YK0 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrc49Q91YK0 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrc49Q91YK0 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrc49Q91YK0 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrc49Q91YK0 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrc49Q91YK0 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrc49Q91YK0 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrc49Q91YK0 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrc49Q91YK0 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrc49Q91YK0 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrc49Q91YK0 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrc49Q91YK0 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrc49Q91YK0 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrc49Q91YK0 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrc49Q91YK0 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrc49Q91YK0 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrc49Q91YK0 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrc49Q91YK0 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrc49Q91YK0 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrc49Q91YK0 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrc49Q91YK0 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrc49Q91YK0 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrc49Q91YK0 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrc49Q91YK0 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrc49Q91YK0 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrc49Q91YK0 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrc49Q91YK0 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrc49Q91YK0 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrc49Q91YK0 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrc49Q91YK0 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrc49Q91YK0 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrc49Q91YK0 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrc49Q91YK0 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrc49Q91YK0 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrc49Q91YK0 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrc49Q91YK0 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrc49Q91YK0 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrc49Q91YK0 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrc49Q91YK0 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrc49Q91YK0 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrc49Q91YK0 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrc49Q91YK0 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrc49Q91YK0 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrc49Q91YK0 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrc49Q91YK0 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrc49Q91YK0 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrc49Q91YK0 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrc49Q91YK0 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrc49Q91YK0 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrc49Q91YK0 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrc49Q91YK0 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrc49Q91YK0 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrc49Q91YK0 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrc49Q91YK0 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrc49Q91YK0 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrc49Q91YK0 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrc49Q91YK0 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrc49Q91YK0 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrc49Q91YK0 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrc49Q91YK0 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrc49Q91YK0 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrc49Q91YK0 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrc49Q91YK0 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrc49Q91YK0 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrc49Q91YK0 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrc49Q91YK0 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrc49Q91YK0 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrc49Q91YK0 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrc49Q91YK0 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrc49Q91YK0 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrc49Q91YK0 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrc49Q91YK0 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrc49Q91YK0 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrc49Q91YK0 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrc49Q91YK0 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrc49Q91YK0 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrc49Q91YK0 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrc49Q91YK0 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrc49Q91YK0 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrc49Q91YK0 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrc49Q91YK0 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrc49Q91YK0 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrc49Q91YK0 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrc49Q91YK0 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrc49Q91YK0 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrc49Q91YK0 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrc49Q91YK0 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrc49Q91YK0 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrc49Q91YK0 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms