Protein–RNA interactions for Protein: Q91YH5

Atl3, Atlastin-3, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atl3Q91YH5 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Atl3Q91YH5 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Atl3Q91YH5 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Atl3Q91YH5 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atl3Q91YH5 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atl3Q91YH5 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atl3Q91YH5 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atl3Q91YH5 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atl3Q91YH5 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atl3Q91YH5 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atl3Q91YH5 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atl3Q91YH5 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atl3Q91YH5 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atl3Q91YH5 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atl3Q91YH5 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atl3Q91YH5 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atl3Q91YH5 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atl3Q91YH5 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atl3Q91YH5 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atl3Q91YH5 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atl3Q91YH5 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atl3Q91YH5 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atl3Q91YH5 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atl3Q91YH5 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Atl3Q91YH5 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Atl3Q91YH5 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Atl3Q91YH5 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Atl3Q91YH5 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Atl3Q91YH5 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Atl3Q91YH5 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Atl3Q91YH5 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Atl3Q91YH5 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Atl3Q91YH5 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Atl3Q91YH5 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Atl3Q91YH5 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Atl3Q91YH5 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Atl3Q91YH5 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Atl3Q91YH5 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Atl3Q91YH5 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Atl3Q91YH5 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Atl3Q91YH5 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Atl3Q91YH5 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Atl3Q91YH5 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Atl3Q91YH5 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Atl3Q91YH5 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Atl3Q91YH5 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Atl3Q91YH5 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Atl3Q91YH5 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Atl3Q91YH5 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Atl3Q91YH5 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Atl3Q91YH5 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Atl3Q91YH5 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Atl3Q91YH5 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Atl3Q91YH5 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Atl3Q91YH5 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Atl3Q91YH5 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Atl3Q91YH5 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Atl3Q91YH5 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Atl3Q91YH5 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Atl3Q91YH5 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Atl3Q91YH5 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Atl3Q91YH5 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Atl3Q91YH5 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Atl3Q91YH5 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Atl3Q91YH5 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Atl3Q91YH5 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Atl3Q91YH5 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Atl3Q91YH5 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Atl3Q91YH5 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Atl3Q91YH5 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Atl3Q91YH5 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Atl3Q91YH5 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Atl3Q91YH5 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Atl3Q91YH5 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Atl3Q91YH5 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Atl3Q91YH5 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Atl3Q91YH5 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Atl3Q91YH5 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Atl3Q91YH5 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Atl3Q91YH5 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Atl3Q91YH5 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Atl3Q91YH5 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Atl3Q91YH5 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Atl3Q91YH5 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Atl3Q91YH5 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Atl3Q91YH5 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Atl3Q91YH5 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Atl3Q91YH5 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Atl3Q91YH5 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Atl3Q91YH5 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Atl3Q91YH5 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Atl3Q91YH5 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Atl3Q91YH5 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Atl3Q91YH5 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Atl3Q91YH5 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Atl3Q91YH5 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Atl3Q91YH5 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Atl3Q91YH5 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Atl3Q91YH5 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Atl3Q91YH5 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms