Protein–RNA interactions for Protein: Q91XD2

Lims2, LIM and senescent cell antigen-like-containing domain protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lims2Q91XD2 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lims2Q91XD2 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lims2Q91XD2 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lims2Q91XD2 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lims2Q91XD2 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lims2Q91XD2 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lims2Q91XD2 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lims2Q91XD2 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lims2Q91XD2 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lims2Q91XD2 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lims2Q91XD2 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lims2Q91XD2 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lims2Q91XD2 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lims2Q91XD2 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lims2Q91XD2 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lims2Q91XD2 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lims2Q91XD2 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lims2Q91XD2 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lims2Q91XD2 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lims2Q91XD2 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lims2Q91XD2 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lims2Q91XD2 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lims2Q91XD2 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lims2Q91XD2 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lims2Q91XD2 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lims2Q91XD2 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Lims2Q91XD2 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lims2Q91XD2 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Lims2Q91XD2 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lims2Q91XD2 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lims2Q91XD2 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lims2Q91XD2 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lims2Q91XD2 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lims2Q91XD2 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lims2Q91XD2 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lims2Q91XD2 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lims2Q91XD2 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lims2Q91XD2 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lims2Q91XD2 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lims2Q91XD2 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Lims2Q91XD2 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Lims2Q91XD2 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Lims2Q91XD2 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Lims2Q91XD2 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Lims2Q91XD2 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lims2Q91XD2 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lims2Q91XD2 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lims2Q91XD2 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lims2Q91XD2 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lims2Q91XD2 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lims2Q91XD2 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lims2Q91XD2 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lims2Q91XD2 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lims2Q91XD2 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lims2Q91XD2 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lims2Q91XD2 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lims2Q91XD2 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lims2Q91XD2 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lims2Q91XD2 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lims2Q91XD2 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Lims2Q91XD2 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Lims2Q91XD2 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lims2Q91XD2 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lims2Q91XD2 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lims2Q91XD2 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lims2Q91XD2 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lims2Q91XD2 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lims2Q91XD2 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lims2Q91XD2 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lims2Q91XD2 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lims2Q91XD2 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lims2Q91XD2 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lims2Q91XD2 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lims2Q91XD2 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lims2Q91XD2 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lims2Q91XD2 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lims2Q91XD2 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lims2Q91XD2 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lims2Q91XD2 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lims2Q91XD2 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Lims2Q91XD2 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lims2Q91XD2 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lims2Q91XD2 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Lims2Q91XD2 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lims2Q91XD2 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lims2Q91XD2 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lims2Q91XD2 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lims2Q91XD2 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lims2Q91XD2 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lims2Q91XD2 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lims2Q91XD2 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lims2Q91XD2 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lims2Q91XD2 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lims2Q91XD2 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lims2Q91XD2 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lims2Q91XD2 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lims2Q91XD2 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Lims2Q91XD2 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lims2Q91XD2 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lims2Q91XD2 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms