Protein–RNA interactions for Protein: Q91VB4

Hps3, Hermansky-Pudlak syndrome 3 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,002 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps3Q91VB4 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hps3Q91VB4 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hps3Q91VB4 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hps3Q91VB4 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hps3Q91VB4 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hps3Q91VB4 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Hps3Q91VB4 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hps3Q91VB4 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hps3Q91VB4 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hps3Q91VB4 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hps3Q91VB4 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hps3Q91VB4 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hps3Q91VB4 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hps3Q91VB4 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hps3Q91VB4 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hps3Q91VB4 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hps3Q91VB4 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hps3Q91VB4 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hps3Q91VB4 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hps3Q91VB4 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hps3Q91VB4 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hps3Q91VB4 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hps3Q91VB4 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hps3Q91VB4 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hps3Q91VB4 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hps3Q91VB4 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hps3Q91VB4 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hps3Q91VB4 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hps3Q91VB4 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Hps3Q91VB4 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hps3Q91VB4 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hps3Q91VB4 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Hps3Q91VB4 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hps3Q91VB4 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hps3Q91VB4 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hps3Q91VB4 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hps3Q91VB4 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hps3Q91VB4 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hps3Q91VB4 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hps3Q91VB4 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hps3Q91VB4 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hps3Q91VB4 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hps3Q91VB4 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hps3Q91VB4 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hps3Q91VB4 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hps3Q91VB4 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hps3Q91VB4 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hps3Q91VB4 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Hps3Q91VB4 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hps3Q91VB4 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hps3Q91VB4 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hps3Q91VB4 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hps3Q91VB4 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hps3Q91VB4 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hps3Q91VB4 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Hps3Q91VB4 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Hps3Q91VB4 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Hps3Q91VB4 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Hps3Q91VB4 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Hps3Q91VB4 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Hps3Q91VB4 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Hps3Q91VB4 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Hps3Q91VB4 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hps3Q91VB4 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hps3Q91VB4 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hps3Q91VB4 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hps3Q91VB4 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hps3Q91VB4 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hps3Q91VB4 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hps3Q91VB4 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hps3Q91VB4 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hps3Q91VB4 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hps3Q91VB4 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hps3Q91VB4 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hps3Q91VB4 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hps3Q91VB4 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hps3Q91VB4 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hps3Q91VB4 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hps3Q91VB4 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hps3Q91VB4 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hps3Q91VB4 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hps3Q91VB4 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hps3Q91VB4 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hps3Q91VB4 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hps3Q91VB4 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hps3Q91VB4 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hps3Q91VB4 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hps3Q91VB4 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hps3Q91VB4 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hps3Q91VB4 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hps3Q91VB4 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hps3Q91VB4 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hps3Q91VB4 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Hps3Q91VB4 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hps3Q91VB4 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hps3Q91VB4 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hps3Q91VB4 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hps3Q91VB4 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hps3Q91VB4 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hps3Q91VB4 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms