Protein–RNA interactions for Protein: Q8VI88

Odf4, Outer dense fiber protein 4, mousemouse

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Length 290 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf4Q8VI88 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Odf4Q8VI88 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Odf4Q8VI88 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Odf4Q8VI88 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Odf4Q8VI88 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Odf4Q8VI88 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Odf4Q8VI88 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Odf4Q8VI88 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Odf4Q8VI88 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Odf4Q8VI88 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Odf4Q8VI88 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Odf4Q8VI88 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Odf4Q8VI88 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Odf4Q8VI88 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Odf4Q8VI88 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Odf4Q8VI88 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Odf4Q8VI88 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Odf4Q8VI88 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Odf4Q8VI88 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Odf4Q8VI88 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Odf4Q8VI88 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Odf4Q8VI88 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Odf4Q8VI88 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Odf4Q8VI88 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Odf4Q8VI88 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Odf4Q8VI88 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Odf4Q8VI88 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Odf4Q8VI88 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Odf4Q8VI88 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Odf4Q8VI88 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Odf4Q8VI88 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Odf4Q8VI88 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Odf4Q8VI88 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Odf4Q8VI88 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Odf4Q8VI88 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Odf4Q8VI88 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Odf4Q8VI88 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Odf4Q8VI88 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Odf4Q8VI88 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Odf4Q8VI88 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Odf4Q8VI88 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Odf4Q8VI88 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Odf4Q8VI88 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Odf4Q8VI88 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Odf4Q8VI88 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Odf4Q8VI88 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Odf4Q8VI88 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Odf4Q8VI88 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Odf4Q8VI88 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Odf4Q8VI88 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Odf4Q8VI88 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Odf4Q8VI88 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Odf4Q8VI88 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Odf4Q8VI88 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Odf4Q8VI88 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Odf4Q8VI88 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Odf4Q8VI88 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Odf4Q8VI88 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Odf4Q8VI88 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Odf4Q8VI88 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Odf4Q8VI88 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Odf4Q8VI88 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Odf4Q8VI88 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Odf4Q8VI88 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Odf4Q8VI88 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Odf4Q8VI88 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Odf4Q8VI88 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Odf4Q8VI88 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Odf4Q8VI88 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Odf4Q8VI88 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Odf4Q8VI88 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Odf4Q8VI88 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Odf4Q8VI88 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Odf4Q8VI88 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Odf4Q8VI88 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Odf4Q8VI88 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Odf4Q8VI88 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Odf4Q8VI88 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Odf4Q8VI88 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Odf4Q8VI88 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Odf4Q8VI88 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Odf4Q8VI88 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Odf4Q8VI88 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Odf4Q8VI88 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Odf4Q8VI88 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Odf4Q8VI88 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Odf4Q8VI88 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Odf4Q8VI88 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Odf4Q8VI88 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Odf4Q8VI88 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Odf4Q8VI88 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Odf4Q8VI88 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Odf4Q8VI88 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Odf4Q8VI88 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Odf4Q8VI88 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Odf4Q8VI88 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Odf4Q8VI88 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Odf4Q8VI88 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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