Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHC5

Cabp4, Calcium-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cabp4Q8VHC5 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cabp4Q8VHC5 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cabp4Q8VHC5 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cabp4Q8VHC5 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cabp4Q8VHC5 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cabp4Q8VHC5 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Cabp4Q8VHC5 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Cabp4Q8VHC5 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Cabp4Q8VHC5 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cabp4Q8VHC5 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cabp4Q8VHC5 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cabp4Q8VHC5 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Cabp4Q8VHC5 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cabp4Q8VHC5 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cabp4Q8VHC5 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cabp4Q8VHC5 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cabp4Q8VHC5 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cabp4Q8VHC5 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cabp4Q8VHC5 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cabp4Q8VHC5 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cabp4Q8VHC5 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cabp4Q8VHC5 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cabp4Q8VHC5 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cabp4Q8VHC5 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cabp4Q8VHC5 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cabp4Q8VHC5 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cabp4Q8VHC5 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cabp4Q8VHC5 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cabp4Q8VHC5 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cabp4Q8VHC5 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cabp4Q8VHC5 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Cabp4Q8VHC5 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cabp4Q8VHC5 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cabp4Q8VHC5 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cabp4Q8VHC5 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cabp4Q8VHC5 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cabp4Q8VHC5 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cabp4Q8VHC5 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cabp4Q8VHC5 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cabp4Q8VHC5 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cabp4Q8VHC5 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cabp4Q8VHC5 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cabp4Q8VHC5 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Cabp4Q8VHC5 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cabp4Q8VHC5 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Cabp4Q8VHC5 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cabp4Q8VHC5 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cabp4Q8VHC5 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Cabp4Q8VHC5 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Cabp4Q8VHC5 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cabp4Q8VHC5 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cabp4Q8VHC5 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cabp4Q8VHC5 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cabp4Q8VHC5 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cabp4Q8VHC5 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cabp4Q8VHC5 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cabp4Q8VHC5 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cabp4Q8VHC5 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cabp4Q8VHC5 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cabp4Q8VHC5 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cabp4Q8VHC5 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cabp4Q8VHC5 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Cabp4Q8VHC5 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cabp4Q8VHC5 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cabp4Q8VHC5 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cabp4Q8VHC5 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cabp4Q8VHC5 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cabp4Q8VHC5 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cabp4Q8VHC5 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cabp4Q8VHC5 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cabp4Q8VHC5 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cabp4Q8VHC5 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cabp4Q8VHC5 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cabp4Q8VHC5 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cabp4Q8VHC5 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cabp4Q8VHC5 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cabp4Q8VHC5 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cabp4Q8VHC5 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cabp4Q8VHC5 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cabp4Q8VHC5 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cabp4Q8VHC5 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cabp4Q8VHC5 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cabp4Q8VHC5 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cabp4Q8VHC5 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Cabp4Q8VHC5 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cabp4Q8VHC5 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cabp4Q8VHC5 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cabp4Q8VHC5 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cabp4Q8VHC5 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cabp4Q8VHC5 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cabp4Q8VHC5 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cabp4Q8VHC5 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cabp4Q8VHC5 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cabp4Q8VHC5 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cabp4Q8VHC5 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cabp4Q8VHC5 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cabp4Q8VHC5 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cabp4Q8VHC5 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cabp4Q8VHC5 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cabp4Q8VHC5 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms