Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEJ9

Vps4a, Vacuolar protein sorting-associated protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps4aQ8VEJ9 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vps4aQ8VEJ9 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vps4aQ8VEJ9 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vps4aQ8VEJ9 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vps4aQ8VEJ9 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vps4aQ8VEJ9 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vps4aQ8VEJ9 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vps4aQ8VEJ9 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vps4aQ8VEJ9 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vps4aQ8VEJ9 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vps4aQ8VEJ9 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Vps4aQ8VEJ9 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vps4aQ8VEJ9 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vps4aQ8VEJ9 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vps4aQ8VEJ9 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vps4aQ8VEJ9 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vps4aQ8VEJ9 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vps4aQ8VEJ9 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vps4aQ8VEJ9 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vps4aQ8VEJ9 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vps4aQ8VEJ9 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vps4aQ8VEJ9 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vps4aQ8VEJ9 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vps4aQ8VEJ9 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vps4aQ8VEJ9 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vps4aQ8VEJ9 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vps4aQ8VEJ9 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vps4aQ8VEJ9 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vps4aQ8VEJ9 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vps4aQ8VEJ9 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vps4aQ8VEJ9 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vps4aQ8VEJ9 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vps4aQ8VEJ9 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vps4aQ8VEJ9 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vps4aQ8VEJ9 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vps4aQ8VEJ9 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vps4aQ8VEJ9 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vps4aQ8VEJ9 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vps4aQ8VEJ9 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vps4aQ8VEJ9 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Vps4aQ8VEJ9 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vps4aQ8VEJ9 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vps4aQ8VEJ9 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vps4aQ8VEJ9 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vps4aQ8VEJ9 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vps4aQ8VEJ9 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vps4aQ8VEJ9 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Vps4aQ8VEJ9 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Vps4aQ8VEJ9 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vps4aQ8VEJ9 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vps4aQ8VEJ9 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vps4aQ8VEJ9 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vps4aQ8VEJ9 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vps4aQ8VEJ9 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vps4aQ8VEJ9 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vps4aQ8VEJ9 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vps4aQ8VEJ9 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vps4aQ8VEJ9 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vps4aQ8VEJ9 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vps4aQ8VEJ9 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vps4aQ8VEJ9 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Vps4aQ8VEJ9 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Vps4aQ8VEJ9 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vps4aQ8VEJ9 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vps4aQ8VEJ9 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vps4aQ8VEJ9 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vps4aQ8VEJ9 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vps4aQ8VEJ9 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vps4aQ8VEJ9 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vps4aQ8VEJ9 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vps4aQ8VEJ9 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vps4aQ8VEJ9 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vps4aQ8VEJ9 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vps4aQ8VEJ9 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vps4aQ8VEJ9 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vps4aQ8VEJ9 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Vps4aQ8VEJ9 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vps4aQ8VEJ9 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vps4aQ8VEJ9 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vps4aQ8VEJ9 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vps4aQ8VEJ9 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vps4aQ8VEJ9 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vps4aQ8VEJ9 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vps4aQ8VEJ9 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vps4aQ8VEJ9 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vps4aQ8VEJ9 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vps4aQ8VEJ9 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vps4aQ8VEJ9 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vps4aQ8VEJ9 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vps4aQ8VEJ9 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vps4aQ8VEJ9 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vps4aQ8VEJ9 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vps4aQ8VEJ9 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vps4aQ8VEJ9 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vps4aQ8VEJ9 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vps4aQ8VEJ9 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vps4aQ8VEJ9 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vps4aQ8VEJ9 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vps4aQ8VEJ9 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vps4aQ8VEJ9 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms