Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDU3

Apol9a, Apol9a protein, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apol9aQ8VDU3 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Apol9aQ8VDU3 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Apol9aQ8VDU3 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Apol9aQ8VDU3 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Apol9aQ8VDU3 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Apol9aQ8VDU3 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Apol9aQ8VDU3 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Apol9aQ8VDU3 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Apol9aQ8VDU3 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Apol9aQ8VDU3 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Apol9aQ8VDU3 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Apol9aQ8VDU3 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Apol9aQ8VDU3 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Apol9aQ8VDU3 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Apol9aQ8VDU3 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Apol9aQ8VDU3 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Apol9aQ8VDU3 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Apol9aQ8VDU3 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Apol9aQ8VDU3 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Apol9aQ8VDU3 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Apol9aQ8VDU3 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Apol9aQ8VDU3 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Apol9aQ8VDU3 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Apol9aQ8VDU3 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Apol9aQ8VDU3 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Apol9aQ8VDU3 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Apol9aQ8VDU3 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Apol9aQ8VDU3 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Apol9aQ8VDU3 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Apol9aQ8VDU3 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Apol9aQ8VDU3 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Apol9aQ8VDU3 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Apol9aQ8VDU3 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Apol9aQ8VDU3 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Apol9aQ8VDU3 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Apol9aQ8VDU3 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Apol9aQ8VDU3 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Apol9aQ8VDU3 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Apol9aQ8VDU3 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Apol9aQ8VDU3 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Apol9aQ8VDU3 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Apol9aQ8VDU3 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Apol9aQ8VDU3 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Apol9aQ8VDU3 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Apol9aQ8VDU3 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Apol9aQ8VDU3 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Apol9aQ8VDU3 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Apol9aQ8VDU3 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Apol9aQ8VDU3 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Apol9aQ8VDU3 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Apol9aQ8VDU3 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Apol9aQ8VDU3 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Apol9aQ8VDU3 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Apol9aQ8VDU3 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Apol9aQ8VDU3 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Apol9aQ8VDU3 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Apol9aQ8VDU3 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Apol9aQ8VDU3 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Apol9aQ8VDU3 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Apol9aQ8VDU3 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Apol9aQ8VDU3 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Apol9aQ8VDU3 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Apol9aQ8VDU3 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Apol9aQ8VDU3 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Apol9aQ8VDU3 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Apol9aQ8VDU3 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Apol9aQ8VDU3 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Apol9aQ8VDU3 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Apol9aQ8VDU3 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Apol9aQ8VDU3 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Apol9aQ8VDU3 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Apol9aQ8VDU3 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Apol9aQ8VDU3 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Apol9aQ8VDU3 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Apol9aQ8VDU3 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Apol9aQ8VDU3 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Apol9aQ8VDU3 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Apol9aQ8VDU3 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Apol9aQ8VDU3 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Apol9aQ8VDU3 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Apol9aQ8VDU3 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Apol9aQ8VDU3 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Apol9aQ8VDU3 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Apol9aQ8VDU3 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Apol9aQ8VDU3 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Apol9aQ8VDU3 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Apol9aQ8VDU3 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Apol9aQ8VDU3 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Apol9aQ8VDU3 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Apol9aQ8VDU3 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Apol9aQ8VDU3 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Apol9aQ8VDU3 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Apol9aQ8VDU3 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Apol9aQ8VDU3 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Apol9aQ8VDU3 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Apol9aQ8VDU3 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Apol9aQ8VDU3 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Apol9aQ8VDU3 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Apol9aQ8VDU3 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Apol9aQ8VDU3 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms