Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDN4

Ccdc92, Coiled-coil domain-containing protein 92, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc92Q8VDN4 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc92Q8VDN4 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc92Q8VDN4 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc92Q8VDN4 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc92Q8VDN4 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc92Q8VDN4 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc92Q8VDN4 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc92Q8VDN4 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc92Q8VDN4 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc92Q8VDN4 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc92Q8VDN4 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc92Q8VDN4 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc92Q8VDN4 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc92Q8VDN4 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc92Q8VDN4 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc92Q8VDN4 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc92Q8VDN4 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc92Q8VDN4 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc92Q8VDN4 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc92Q8VDN4 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc92Q8VDN4 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc92Q8VDN4 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc92Q8VDN4 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc92Q8VDN4 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc92Q8VDN4 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc92Q8VDN4 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc92Q8VDN4 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc92Q8VDN4 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc92Q8VDN4 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc92Q8VDN4 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc92Q8VDN4 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc92Q8VDN4 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc92Q8VDN4 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc92Q8VDN4 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc92Q8VDN4 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc92Q8VDN4 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc92Q8VDN4 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc92Q8VDN4 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc92Q8VDN4 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc92Q8VDN4 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc92Q8VDN4 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc92Q8VDN4 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc92Q8VDN4 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc92Q8VDN4 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc92Q8VDN4 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc92Q8VDN4 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc92Q8VDN4 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc92Q8VDN4 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc92Q8VDN4 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc92Q8VDN4 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc92Q8VDN4 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc92Q8VDN4 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc92Q8VDN4 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc92Q8VDN4 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc92Q8VDN4 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc92Q8VDN4 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc92Q8VDN4 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc92Q8VDN4 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc92Q8VDN4 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc92Q8VDN4 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc92Q8VDN4 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc92Q8VDN4 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc92Q8VDN4 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc92Q8VDN4 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc92Q8VDN4 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc92Q8VDN4 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc92Q8VDN4 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc92Q8VDN4 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc92Q8VDN4 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc92Q8VDN4 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc92Q8VDN4 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc92Q8VDN4 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc92Q8VDN4 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc92Q8VDN4 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc92Q8VDN4 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc92Q8VDN4 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc92Q8VDN4 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc92Q8VDN4 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc92Q8VDN4 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc92Q8VDN4 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc92Q8VDN4 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc92Q8VDN4 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc92Q8VDN4 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc92Q8VDN4 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc92Q8VDN4 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc92Q8VDN4 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc92Q8VDN4 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc92Q8VDN4 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc92Q8VDN4 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc92Q8VDN4 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc92Q8VDN4 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc92Q8VDN4 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc92Q8VDN4 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc92Q8VDN4 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc92Q8VDN4 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc92Q8VDN4 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc92Q8VDN4 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc92Q8VDN4 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc92Q8VDN4 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc92Q8VDN4 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms