Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCZ8

Rpusd1, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 306 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd1Q8VCZ8 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Rpusd1Q8VCZ8 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpusd1Q8VCZ8 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpusd1Q8VCZ8 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpusd1Q8VCZ8 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpusd1Q8VCZ8 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Rpusd1Q8VCZ8 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpusd1Q8VCZ8 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpusd1Q8VCZ8 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Rpusd1Q8VCZ8 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpusd1Q8VCZ8 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpusd1Q8VCZ8 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpusd1Q8VCZ8 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Rpusd1Q8VCZ8 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpusd1Q8VCZ8 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpusd1Q8VCZ8 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpusd1Q8VCZ8 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpusd1Q8VCZ8 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpusd1Q8VCZ8 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Rpusd1Q8VCZ8 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpusd1Q8VCZ8 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpusd1Q8VCZ8 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpusd1Q8VCZ8 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpusd1Q8VCZ8 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpusd1Q8VCZ8 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpusd1Q8VCZ8 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Rpusd1Q8VCZ8 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Rpusd1Q8VCZ8 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Rpusd1Q8VCZ8 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Rpusd1Q8VCZ8 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Rpusd1Q8VCZ8 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpusd1Q8VCZ8 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Rpusd1Q8VCZ8 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpusd1Q8VCZ8 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpusd1Q8VCZ8 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpusd1Q8VCZ8 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpusd1Q8VCZ8 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpusd1Q8VCZ8 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpusd1Q8VCZ8 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpusd1Q8VCZ8 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpusd1Q8VCZ8 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rpusd1Q8VCZ8 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpusd1Q8VCZ8 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpusd1Q8VCZ8 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpusd1Q8VCZ8 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpusd1Q8VCZ8 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpusd1Q8VCZ8 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpusd1Q8VCZ8 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpusd1Q8VCZ8 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Rpusd1Q8VCZ8 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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