Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCS3

Fam20b, Glycosaminoglycan xylosylkinase, mousemouse

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Length 409 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam20bQ8VCS3 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fam20bQ8VCS3 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fam20bQ8VCS3 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fam20bQ8VCS3 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fam20bQ8VCS3 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fam20bQ8VCS3 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fam20bQ8VCS3 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Fam20bQ8VCS3 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fam20bQ8VCS3 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fam20bQ8VCS3 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fam20bQ8VCS3 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fam20bQ8VCS3 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fam20bQ8VCS3 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fam20bQ8VCS3 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fam20bQ8VCS3 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fam20bQ8VCS3 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fam20bQ8VCS3 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fam20bQ8VCS3 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fam20bQ8VCS3 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fam20bQ8VCS3 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fam20bQ8VCS3 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fam20bQ8VCS3 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fam20bQ8VCS3 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fam20bQ8VCS3 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fam20bQ8VCS3 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fam20bQ8VCS3 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fam20bQ8VCS3 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fam20bQ8VCS3 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fam20bQ8VCS3 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Fam20bQ8VCS3 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fam20bQ8VCS3 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fam20bQ8VCS3 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fam20bQ8VCS3 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fam20bQ8VCS3 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fam20bQ8VCS3 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fam20bQ8VCS3 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fam20bQ8VCS3 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fam20bQ8VCS3 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fam20bQ8VCS3 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fam20bQ8VCS3 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fam20bQ8VCS3 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fam20bQ8VCS3 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Fam20bQ8VCS3 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fam20bQ8VCS3 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fam20bQ8VCS3 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fam20bQ8VCS3 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fam20bQ8VCS3 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fam20bQ8VCS3 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fam20bQ8VCS3 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fam20bQ8VCS3 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fam20bQ8VCS3 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fam20bQ8VCS3 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fam20bQ8VCS3 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fam20bQ8VCS3 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fam20bQ8VCS3 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fam20bQ8VCS3 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fam20bQ8VCS3 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fam20bQ8VCS3 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fam20bQ8VCS3 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Fam20bQ8VCS3 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fam20bQ8VCS3 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fam20bQ8VCS3 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fam20bQ8VCS3 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fam20bQ8VCS3 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fam20bQ8VCS3 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fam20bQ8VCS3 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
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Fam20bQ8VCS3 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fam20bQ8VCS3 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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Fam20bQ8VCS3 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fam20bQ8VCS3 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fam20bQ8VCS3 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fam20bQ8VCS3 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fam20bQ8VCS3 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fam20bQ8VCS3 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fam20bQ8VCS3 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fam20bQ8VCS3 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fam20bQ8VCS3 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fam20bQ8VCS3 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fam20bQ8VCS3 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fam20bQ8VCS3 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fam20bQ8VCS3 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Fam20bQ8VCS3 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fam20bQ8VCS3 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fam20bQ8VCS3 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fam20bQ8VCS3 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fam20bQ8VCS3 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fam20bQ8VCS3 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fam20bQ8VCS3 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fam20bQ8VCS3 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fam20bQ8VCS3 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fam20bQ8VCS3 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fam20bQ8VCS3 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fam20bQ8VCS3 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fam20bQ8VCS3 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fam20bQ8VCS3 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fam20bQ8VCS3 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fam20bQ8VCS3 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fam20bQ8VCS3 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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