Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCC8

Rapgef3, Rap guanine nucleotide exchange factor 3, mousemouse

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Length 918 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rapgef3Q8VCC8 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Rapgef3Q8VCC8 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rapgef3Q8VCC8 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rapgef3Q8VCC8 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rapgef3Q8VCC8 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rapgef3Q8VCC8 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rapgef3Q8VCC8 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rapgef3Q8VCC8 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rapgef3Q8VCC8 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rapgef3Q8VCC8 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rapgef3Q8VCC8 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rapgef3Q8VCC8 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rapgef3Q8VCC8 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rapgef3Q8VCC8 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rapgef3Q8VCC8 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rapgef3Q8VCC8 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rapgef3Q8VCC8 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rapgef3Q8VCC8 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rapgef3Q8VCC8 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rapgef3Q8VCC8 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rapgef3Q8VCC8 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rapgef3Q8VCC8 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rapgef3Q8VCC8 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rapgef3Q8VCC8 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Rapgef3Q8VCC8 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Rapgef3Q8VCC8 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rapgef3Q8VCC8 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Rapgef3Q8VCC8 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Rapgef3Q8VCC8 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Rapgef3Q8VCC8 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Rapgef3Q8VCC8 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rapgef3Q8VCC8 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Rapgef3Q8VCC8 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Rapgef3Q8VCC8 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Rapgef3Q8VCC8 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Rapgef3Q8VCC8 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Rapgef3Q8VCC8 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rapgef3Q8VCC8 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Rapgef3Q8VCC8 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Rapgef3Q8VCC8 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Rapgef3Q8VCC8 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Rapgef3Q8VCC8 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Rapgef3Q8VCC8 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rapgef3Q8VCC8 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Rapgef3Q8VCC8 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Rapgef3Q8VCC8 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rapgef3Q8VCC8 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rapgef3Q8VCC8 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rapgef3Q8VCC8 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rapgef3Q8VCC8 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rapgef3Q8VCC8 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rapgef3Q8VCC8 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Rapgef3Q8VCC8 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Rapgef3Q8VCC8 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Rapgef3Q8VCC8 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Rapgef3Q8VCC8 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rapgef3Q8VCC8 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rapgef3Q8VCC8 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rapgef3Q8VCC8 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rapgef3Q8VCC8 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Rapgef3Q8VCC8 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rapgef3Q8VCC8 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rapgef3Q8VCC8 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rapgef3Q8VCC8 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rapgef3Q8VCC8 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rapgef3Q8VCC8 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rapgef3Q8VCC8 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rapgef3Q8VCC8 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rapgef3Q8VCC8 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Rapgef3Q8VCC8 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rapgef3Q8VCC8 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Rapgef3Q8VCC8 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rapgef3Q8VCC8 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Rapgef3Q8VCC8 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rapgef3Q8VCC8 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Rapgef3Q8VCC8 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rapgef3Q8VCC8 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rapgef3Q8VCC8 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rapgef3Q8VCC8 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rapgef3Q8VCC8 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rapgef3Q8VCC8 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rapgef3Q8VCC8 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rapgef3Q8VCC8 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rapgef3Q8VCC8 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rapgef3Q8VCC8 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rapgef3Q8VCC8 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rapgef3Q8VCC8 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rapgef3Q8VCC8 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rapgef3Q8VCC8 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rapgef3Q8VCC8 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rapgef3Q8VCC8 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rapgef3Q8VCC8 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rapgef3Q8VCC8 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rapgef3Q8VCC8 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rapgef3Q8VCC8 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rapgef3Q8VCC8 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rapgef3Q8VCC8 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rapgef3Q8VCC8 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rapgef3Q8VCC8 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rapgef3Q8VCC8 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
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