Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4D1

Slc9a8, Sodium/hydrogen exchanger 8, mousemouse

Predictions only

Length 576 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc9a8Q8R4D1 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc9a8Q8R4D1 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc9a8Q8R4D1 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc9a8Q8R4D1 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc9a8Q8R4D1 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc9a8Q8R4D1 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc9a8Q8R4D1 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc9a8Q8R4D1 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc9a8Q8R4D1 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc9a8Q8R4D1 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc9a8Q8R4D1 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc9a8Q8R4D1 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc9a8Q8R4D1 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc9a8Q8R4D1 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc9a8Q8R4D1 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc9a8Q8R4D1 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc9a8Q8R4D1 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc9a8Q8R4D1 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc9a8Q8R4D1 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc9a8Q8R4D1 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc9a8Q8R4D1 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc9a8Q8R4D1 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc9a8Q8R4D1 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc9a8Q8R4D1 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc9a8Q8R4D1 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc9a8Q8R4D1 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc9a8Q8R4D1 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc9a8Q8R4D1 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc9a8Q8R4D1 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc9a8Q8R4D1 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc9a8Q8R4D1 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc9a8Q8R4D1 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc9a8Q8R4D1 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc9a8Q8R4D1 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc9a8Q8R4D1 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc9a8Q8R4D1 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc9a8Q8R4D1 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc9a8Q8R4D1 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc9a8Q8R4D1 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc9a8Q8R4D1 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc9a8Q8R4D1 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc9a8Q8R4D1 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc9a8Q8R4D1 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc9a8Q8R4D1 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc9a8Q8R4D1 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc9a8Q8R4D1 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc9a8Q8R4D1 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc9a8Q8R4D1 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc9a8Q8R4D1 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc9a8Q8R4D1 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc9a8Q8R4D1 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc9a8Q8R4D1 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc9a8Q8R4D1 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc9a8Q8R4D1 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc9a8Q8R4D1 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc9a8Q8R4D1 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc9a8Q8R4D1 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc9a8Q8R4D1 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc9a8Q8R4D1 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc9a8Q8R4D1 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc9a8Q8R4D1 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc9a8Q8R4D1 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc9a8Q8R4D1 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc9a8Q8R4D1 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc9a8Q8R4D1 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc9a8Q8R4D1 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc9a8Q8R4D1 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc9a8Q8R4D1 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc9a8Q8R4D1 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc9a8Q8R4D1 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc9a8Q8R4D1 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc9a8Q8R4D1 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc9a8Q8R4D1 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc9a8Q8R4D1 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc9a8Q8R4D1 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc9a8Q8R4D1 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc9a8Q8R4D1 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc9a8Q8R4D1 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc9a8Q8R4D1 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc9a8Q8R4D1 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc9a8Q8R4D1 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc9a8Q8R4D1 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc9a8Q8R4D1 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc9a8Q8R4D1 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc9a8Q8R4D1 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc9a8Q8R4D1 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc9a8Q8R4D1 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc9a8Q8R4D1 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc9a8Q8R4D1 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc9a8Q8R4D1 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc9a8Q8R4D1 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc9a8Q8R4D1 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc9a8Q8R4D1 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc9a8Q8R4D1 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc9a8Q8R4D1 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc9a8Q8R4D1 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc9a8Q8R4D1 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc9a8Q8R4D1 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc9a8Q8R4D1 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc9a8Q8R4D1 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms