Protein–RNA interactions for Protein: Q8R373

Clmp, CXADR-like membrane protein, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClmpQ8R373 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ClmpQ8R373 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ClmpQ8R373 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ClmpQ8R373 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ClmpQ8R373 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ClmpQ8R373 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ClmpQ8R373 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ClmpQ8R373 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ClmpQ8R373 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ClmpQ8R373 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ClmpQ8R373 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ClmpQ8R373 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ClmpQ8R373 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ClmpQ8R373 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ClmpQ8R373 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ClmpQ8R373 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ClmpQ8R373 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ClmpQ8R373 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ClmpQ8R373 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ClmpQ8R373 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ClmpQ8R373 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ClmpQ8R373 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ClmpQ8R373 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ClmpQ8R373 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ClmpQ8R373 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ClmpQ8R373 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ClmpQ8R373 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ClmpQ8R373 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ClmpQ8R373 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ClmpQ8R373 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ClmpQ8R373 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ClmpQ8R373 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ClmpQ8R373 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ClmpQ8R373 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ClmpQ8R373 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ClmpQ8R373 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ClmpQ8R373 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ClmpQ8R373 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ClmpQ8R373 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ClmpQ8R373 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ClmpQ8R373 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ClmpQ8R373 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ClmpQ8R373 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ClmpQ8R373 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ClmpQ8R373 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ClmpQ8R373 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ClmpQ8R373 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ClmpQ8R373 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ClmpQ8R373 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ClmpQ8R373 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ClmpQ8R373 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ClmpQ8R373 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ClmpQ8R373 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ClmpQ8R373 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ClmpQ8R373 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ClmpQ8R373 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ClmpQ8R373 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ClmpQ8R373 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ClmpQ8R373 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ClmpQ8R373 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ClmpQ8R373 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ClmpQ8R373 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ClmpQ8R373 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ClmpQ8R373 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ClmpQ8R373 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ClmpQ8R373 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ClmpQ8R373 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ClmpQ8R373 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ClmpQ8R373 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ClmpQ8R373 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ClmpQ8R373 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ClmpQ8R373 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ClmpQ8R373 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ClmpQ8R373 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ClmpQ8R373 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ClmpQ8R373 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ClmpQ8R373 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ClmpQ8R373 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ClmpQ8R373 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ClmpQ8R373 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ClmpQ8R373 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ClmpQ8R373 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ClmpQ8R373 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ClmpQ8R373 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ClmpQ8R373 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ClmpQ8R373 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ClmpQ8R373 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ClmpQ8R373 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ClmpQ8R373 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ClmpQ8R373 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ClmpQ8R373 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ClmpQ8R373 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ClmpQ8R373 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ClmpQ8R373 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ClmpQ8R373 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ClmpQ8R373 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ClmpQ8R373 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ClmpQ8R373 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ClmpQ8R373 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ClmpQ8R373 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms