Protein–RNA interactions for Protein: Q8QZY9

Sf3b4, Splicing factor 3B subunit 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b4Q8QZY9 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sf3b4Q8QZY9 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sf3b4Q8QZY9 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sf3b4Q8QZY9 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sf3b4Q8QZY9 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sf3b4Q8QZY9 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sf3b4Q8QZY9 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sf3b4Q8QZY9 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sf3b4Q8QZY9 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sf3b4Q8QZY9 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sf3b4Q8QZY9 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sf3b4Q8QZY9 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sf3b4Q8QZY9 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sf3b4Q8QZY9 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sf3b4Q8QZY9 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sf3b4Q8QZY9 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sf3b4Q8QZY9 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sf3b4Q8QZY9 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sf3b4Q8QZY9 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Sf3b4Q8QZY9 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Sf3b4Q8QZY9 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sf3b4Q8QZY9 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sf3b4Q8QZY9 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sf3b4Q8QZY9 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sf3b4Q8QZY9 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sf3b4Q8QZY9 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sf3b4Q8QZY9 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sf3b4Q8QZY9 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sf3b4Q8QZY9 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sf3b4Q8QZY9 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sf3b4Q8QZY9 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sf3b4Q8QZY9 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sf3b4Q8QZY9 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sf3b4Q8QZY9 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sf3b4Q8QZY9 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sf3b4Q8QZY9 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sf3b4Q8QZY9 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sf3b4Q8QZY9 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sf3b4Q8QZY9 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sf3b4Q8QZY9 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sf3b4Q8QZY9 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sf3b4Q8QZY9 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sf3b4Q8QZY9 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sf3b4Q8QZY9 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sf3b4Q8QZY9 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sf3b4Q8QZY9 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sf3b4Q8QZY9 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sf3b4Q8QZY9 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sf3b4Q8QZY9 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sf3b4Q8QZY9 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sf3b4Q8QZY9 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sf3b4Q8QZY9 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Sf3b4Q8QZY9 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sf3b4Q8QZY9 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sf3b4Q8QZY9 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sf3b4Q8QZY9 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sf3b4Q8QZY9 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sf3b4Q8QZY9 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sf3b4Q8QZY9 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sf3b4Q8QZY9 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sf3b4Q8QZY9 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Sf3b4Q8QZY9 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sf3b4Q8QZY9 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sf3b4Q8QZY9 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sf3b4Q8QZY9 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sf3b4Q8QZY9 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sf3b4Q8QZY9 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sf3b4Q8QZY9 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Sf3b4Q8QZY9 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sf3b4Q8QZY9 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sf3b4Q8QZY9 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sf3b4Q8QZY9 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sf3b4Q8QZY9 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sf3b4Q8QZY9 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sf3b4Q8QZY9 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sf3b4Q8QZY9 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Sf3b4Q8QZY9 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sf3b4Q8QZY9 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sf3b4Q8QZY9 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sf3b4Q8QZY9 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sf3b4Q8QZY9 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sf3b4Q8QZY9 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sf3b4Q8QZY9 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sf3b4Q8QZY9 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sf3b4Q8QZY9 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sf3b4Q8QZY9 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sf3b4Q8QZY9 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sf3b4Q8QZY9 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sf3b4Q8QZY9 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sf3b4Q8QZY9 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sf3b4Q8QZY9 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sf3b4Q8QZY9 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sf3b4Q8QZY9 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sf3b4Q8QZY9 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sf3b4Q8QZY9 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Sf3b4Q8QZY9 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sf3b4Q8QZY9 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sf3b4Q8QZY9 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sf3b4Q8QZY9 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sf3b4Q8QZY9 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms