Protein–RNA interactions for Protein: Q8K558

Treml1, Trem-like transcript 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Treml1Q8K558 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Treml1Q8K558 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Treml1Q8K558 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Treml1Q8K558 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Treml1Q8K558 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Treml1Q8K558 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Treml1Q8K558 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Treml1Q8K558 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Treml1Q8K558 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Treml1Q8K558 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Treml1Q8K558 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Treml1Q8K558 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Treml1Q8K558 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Treml1Q8K558 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Treml1Q8K558 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Treml1Q8K558 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Treml1Q8K558 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Treml1Q8K558 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Treml1Q8K558 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Treml1Q8K558 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Treml1Q8K558 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Treml1Q8K558 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Treml1Q8K558 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Treml1Q8K558 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Treml1Q8K558 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Treml1Q8K558 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Treml1Q8K558 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Treml1Q8K558 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Treml1Q8K558 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Treml1Q8K558 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Treml1Q8K558 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Treml1Q8K558 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Treml1Q8K558 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Treml1Q8K558 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Treml1Q8K558 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Treml1Q8K558 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Treml1Q8K558 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Treml1Q8K558 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Treml1Q8K558 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Treml1Q8K558 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Treml1Q8K558 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Treml1Q8K558 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Treml1Q8K558 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Treml1Q8K558 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Treml1Q8K558 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Treml1Q8K558 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Treml1Q8K558 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Treml1Q8K558 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Treml1Q8K558 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Treml1Q8K558 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Treml1Q8K558 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Treml1Q8K558 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Treml1Q8K558 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Treml1Q8K558 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Treml1Q8K558 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Treml1Q8K558 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Treml1Q8K558 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Treml1Q8K558 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Treml1Q8K558 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Treml1Q8K558 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Treml1Q8K558 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Treml1Q8K558 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Treml1Q8K558 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Treml1Q8K558 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Treml1Q8K558 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Treml1Q8K558 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Treml1Q8K558 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Treml1Q8K558 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Treml1Q8K558 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Treml1Q8K558 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Treml1Q8K558 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Treml1Q8K558 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Treml1Q8K558 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Treml1Q8K558 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Treml1Q8K558 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Treml1Q8K558 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Treml1Q8K558 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Treml1Q8K558 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Treml1Q8K558 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Treml1Q8K558 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Treml1Q8K558 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Treml1Q8K558 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Treml1Q8K558 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Treml1Q8K558 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Treml1Q8K558 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Treml1Q8K558 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Treml1Q8K558 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Treml1Q8K558 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Treml1Q8K558 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Treml1Q8K558 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Treml1Q8K558 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Treml1Q8K558 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Treml1Q8K558 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Treml1Q8K558 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Treml1Q8K558 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Treml1Q8K558 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Treml1Q8K558 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Treml1Q8K558 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Treml1Q8K558 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Treml1Q8K558 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms